30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0639 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  811    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03863  hypothetical protein  46.67 
 
 		 398 aa  319  6e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1068  putative lipoprotein  41.23 
 
 		 423 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3313  putative lipoprotein  41.5 
 
 		 411 aa  282  9e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.474661  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2414  putative lipoprotein  41.71 
 
 		 410 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286985  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03650  putative lipoprotein  38.86 
 
 		 382 aa  246  6.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3536  putative lipoprotein  38.44 
 
 		 406 aa  243  6e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3303  hypothetical protein  40.2 
 
 		 396 aa  239  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00716702  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2655  hypothetical protein  42.46 
 
 		 396 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3233  hypothetical protein  39.6 
 
 		 396 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3185  hypothetical protein  39.75 
 
 		 396 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  37.77 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2701  hypothetical protein  36.65 
 
 		 405 aa  216  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228985  normal  0.0970727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1225  hypothetical protein  34.52 
 
 		 401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0031  hypothetical protein  35.01 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2969  hypothetical protein  35.7 
 
 		 418 aa  206  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0451316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3869  hypothetical protein  34.88 
 
 		 395 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1265  putative lipoprotein  36.63 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1706  hypothetical protein  35.6 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0324  hypothetical protein  29.28 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2166  putative lipoprotein  26.99 
 
 		 482 aa  151  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.843549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0463  hypothetical protein  30.63 
 
 		 451 aa  130  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0465  hypothetical protein  29.47 
 
 		 329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0050  hypothetical protein  31.19 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00013841  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1099  hypothetical protein  25.92 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1970  hypothetical protein  23.3 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.231871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2382  hypothetical protein  24.06 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0937  hypothetical protein  23.43 
 
 		 564 aa  50.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4630  hypothetical protein  24.23 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2060  hypothetical protein  23.59 
 
 		 450 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.895563  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>