26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2969 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2969  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  841    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0451316  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1706  hypothetical protein  45.62 
 
 		 401 aa  263  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1265  putative lipoprotein  42.67 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  37.05 
 
 		 400 aa  213  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03863  hypothetical protein  33.8 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2701  hypothetical protein  37.76 
 
 		 405 aa  196  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228985  normal  0.0970727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3869  hypothetical protein  39.27 
 
 		 395 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1225  hypothetical protein  38 
 
 		 401 aa  192  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22049  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1068  putative lipoprotein  36.27 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  35.75 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2414  putative lipoprotein  35.25 
 
 		 410 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3313  putative lipoprotein  36.2 
 
 		 411 aa  173  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.474661  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0031  hypothetical protein  33.57 
 
 		 408 aa  162  9e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3185  hypothetical protein  32.25 
 
 		 396 aa  149  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03650  putative lipoprotein  33.25 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3303  hypothetical protein  32.9 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00716702  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3233  hypothetical protein  32.56 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3536  putative lipoprotein  33.69 
 
 		 406 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 396 aa  137  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0463  hypothetical protein  31.03 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505363  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0050  hypothetical protein  29.37 
 
 		 448 aa  127  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00013841  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0465  hypothetical protein  31.09 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2166  putative lipoprotein  26.7 
 
 		 482 aa  100  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.843549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0324  hypothetical protein  24.88 
 
 		 472 aa  99  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4630  hypothetical protein  22.04 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2382  hypothetical protein  25.68 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.238732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>