13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2060 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2060  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  925    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.895563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2382  hypothetical protein  53.26 
 
 		 439 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5403  hypothetical protein  40.85 
 
 		 519 aa  302  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1970  hypothetical protein  33.95 
 
 		 457 aa  199  6e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.231871 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1099  hypothetical protein  31.34 
 
 		 464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4630  hypothetical protein  32.18 
 
 		 419 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0921  hypothetical protein  24.69 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.682885  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2312  hypothetical protein  22.27 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.414585 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3095  hypothetical protein  31.65 
 
 		 163 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513941  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2323  hypothetical protein  24.64 
 
 		 481 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.696472  decreased coverage  0.0026081 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1068  putative lipoprotein  29.56 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3094  hypothetical protein  22.49 
 
 		 238 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.573571  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  23.59 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>