28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1068 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1068  putative lipoprotein  100 
 
 		 423 aa  858    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3313  putative lipoprotein  62.53 
 
 		 411 aa  516  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.474661  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3536  putative lipoprotein  61.92 
 
 		 406 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2414  putative lipoprotein  52.54 
 
 		 410 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286985  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03650  putative lipoprotein  53.79 
 
 		 382 aa  401  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  41.23 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3303  hypothetical protein  41.18 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00716702  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3233  hypothetical protein  39.95 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0031  hypothetical protein  37.14 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2655  hypothetical protein  41.3 
 
 		 396 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3185  hypothetical protein  38.73 
 
 		 396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03863  hypothetical protein  37.67 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3869  hypothetical protein  39.84 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  38.81 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1265  putative lipoprotein  38.03 
 
 		 400 aa  193  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2701  hypothetical protein  35.26 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228985  normal  0.0970727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1225  hypothetical protein  34.5 
 
 		 401 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22049  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2969  hypothetical protein  36.27 
 
 		 418 aa  180  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0451316  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1706  hypothetical protein  33.33 
 
 		 401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2166  putative lipoprotein  29.83 
 
 		 482 aa  155  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.843549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0463  hypothetical protein  31.13 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505363  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0324  hypothetical protein  28.97 
 
 		 472 aa  154  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0050  hypothetical protein  29.24 
 
 		 448 aa  150  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00013841  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0465  hypothetical protein  31.19 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4630  hypothetical protein  28.48 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1099  hypothetical protein  24.84 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2060  hypothetical protein  29.56 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.895563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0734  outer membrane porin  27.4 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>