25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1265 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1265  putative lipoprotein  100 
 
 		 400 aa  804    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1706  hypothetical protein  62.66 
 
 		 401 aa  495  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2969  hypothetical protein  42.21 
 
 		 418 aa  243  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0451316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3869  hypothetical protein  39.36 
 
 		 395 aa  212  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3313  putative lipoprotein  35.56 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.474661  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  36.63 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03863  hypothetical protein  35.56 
 
 		 398 aa  199  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1068  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 423 aa  196  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2701  hypothetical protein  35.1 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228985  normal  0.0970727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1225  hypothetical protein  35.34 
 
 		 401 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22049  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3536  putative lipoprotein  34.68 
 
 		 406 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0031  hypothetical protein  32.6 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  34.55 
 
 		 409 aa  169  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2414  putative lipoprotein  33.5 
 
 		 410 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3303  hypothetical protein  32.28 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00716702  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3233  hypothetical protein  30.73 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03650  putative lipoprotein  30.42 
 
 		 382 aa  149  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2655  hypothetical protein  32.8 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3185  hypothetical protein  30.83 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0050  hypothetical protein  27.72 
 
 		 448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00013841  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0463  hypothetical protein  27.95 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0465  hypothetical protein  31.29 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0324  hypothetical protein  25.21 
 
 		 472 aa  103  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2166  putative lipoprotein  27.2 
 
 		 482 aa  99.8  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.843549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1099  hypothetical protein  24.05 
 
 		 464 aa  50.1  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>