25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0050 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0050  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  910    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00013841  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0463  hypothetical protein  91.83 
 
 		 451 aa  823    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1068  putative lipoprotein  29.24 
 
 		 423 aa  150  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3313  putative lipoprotein  30.34 
 
 		 411 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.474661  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3303  hypothetical protein  30.79 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00716702  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03650  putative lipoprotein  30.27 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3233  hypothetical protein  30.72 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3536  putative lipoprotein  30.83 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0031  hypothetical protein  32.91 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  31.74 
 
 		 409 aa  130  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2655  hypothetical protein  30.64 
 
 		 396 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2701  hypothetical protein  27.79 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228985  normal  0.0970727 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1706  hypothetical protein  27.32 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  31.19 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3185  hypothetical protein  29.31 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2969  hypothetical protein  29.7 
 
 		 418 aa  124  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0451316  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1225  hypothetical protein  27.32 
 
 		 401 aa  123  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22049  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3869  hypothetical protein  29.67 
 
 		 395 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2414  putative lipoprotein  28.05 
 
 		 410 aa  120  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286985  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0324  hypothetical protein  26.78 
 
 		 472 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1265  putative lipoprotein  27.72 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2166  putative lipoprotein  27.04 
 
 		 482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.843549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03863  hypothetical protein  29.51 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0465  hypothetical protein  23.5 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1970  hypothetical protein  44.44 
 
 		 457 aa  43.5  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.231871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>