24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2701 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2701  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  818    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228985  normal  0.0970727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3869  hypothetical protein  45.45 
 
 
395 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03863  hypothetical protein  37.72 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  36.65 
 
 
400 aa  216  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2655  hypothetical protein  36.91 
 
 
396 aa  212  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3313  putative lipoprotein  37.37 
 
 
411 aa  210  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.474661  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3185  hypothetical protein  35.08 
 
 
396 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.624784  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3303  hypothetical protein  35.34 
 
 
396 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00716702  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3233  hypothetical protein  35.41 
 
 
396 aa  199  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1706  hypothetical protein  36.91 
 
 
401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2969  hypothetical protein  37.76 
 
 
418 aa  196  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0451316  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2414  putative lipoprotein  36.04 
 
 
410 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286985  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3536  putative lipoprotein  36.02 
 
 
406 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1068  putative lipoprotein  35.26 
 
 
423 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03650  putative lipoprotein  35.92 
 
 
382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1265  putative lipoprotein  34.56 
 
 
400 aa  186  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1225  hypothetical protein  36.15 
 
 
401 aa  186  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  34.45 
 
 
409 aa  176  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0031  hypothetical protein  30.62 
 
 
408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0465  hypothetical protein  33.23 
 
 
329 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0463  hypothetical protein  28.48 
 
 
451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505363  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0050  hypothetical protein  27.79 
 
 
448 aa  129  9.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00013841  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0324  hypothetical protein  27.91 
 
 
472 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2166  putative lipoprotein  27.27 
 
 
482 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.843549  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>