25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0465 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0465  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  656    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3869  hypothetical protein  34.04 
 
 
395 aa  152  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2701  hypothetical protein  33.23 
 
 
405 aa  145  8.000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228985  normal  0.0970727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  29.47 
 
 
400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1068  putative lipoprotein  31.19 
 
 
423 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2414  putative lipoprotein  31.42 
 
 
410 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286985  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3313  putative lipoprotein  28.83 
 
 
411 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.474661  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03650  putative lipoprotein  30.82 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03863  hypothetical protein  25.53 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2969  hypothetical protein  31.09 
 
 
418 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0451316  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1265  putative lipoprotein  31.29 
 
 
400 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3303  hypothetical protein  27.33 
 
 
396 aa  102  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00716702  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2655  hypothetical protein  27.89 
 
 
396 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3536  putative lipoprotein  28.96 
 
 
406 aa  99.8  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3185  hypothetical protein  26.37 
 
 
396 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.624784  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3233  hypothetical protein  26.87 
 
 
396 aa  96.3  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1706  hypothetical protein  30.95 
 
 
401 aa  96.3  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1225  hypothetical protein  27.41 
 
 
401 aa  96.3  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0031  hypothetical protein  27.92 
 
 
408 aa  91.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  28.61 
 
 
409 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2166  putative lipoprotein  25.56 
 
 
482 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.843549  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0463  hypothetical protein  24.36 
 
 
451 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505363  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0324  hypothetical protein  22.84 
 
 
472 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0050  hypothetical protein  23.5 
 
 
448 aa  69.3  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00013841  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4630  hypothetical protein  23.08 
 
 
419 aa  46.6  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>