24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0324 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2166  putative lipoprotein  66.46 
 
 
482 aa  657    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.843549  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0324  hypothetical protein  100 
 
 
472 aa  973    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3869  hypothetical protein  28.88 
 
 
395 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1225  hypothetical protein  27.81 
 
 
401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22049  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  29.65 
 
 
400 aa  164  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3313  putative lipoprotein  27.97 
 
 
411 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.474661  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1068  putative lipoprotein  28.97 
 
 
423 aa  153  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3233  hypothetical protein  29.74 
 
 
396 aa  153  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2414  putative lipoprotein  28.76 
 
 
410 aa  149  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3303  hypothetical protein  29.04 
 
 
396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00716702  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3536  putative lipoprotein  31.24 
 
 
406 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0031  hypothetical protein  28.21 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3185  hypothetical protein  28.36 
 
 
396 aa  141  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.624784  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2655  hypothetical protein  28.6 
 
 
396 aa  137  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03650  putative lipoprotein  27.39 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03863  hypothetical protein  28.57 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2701  hypothetical protein  27.91 
 
 
405 aa  126  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228985  normal  0.0970727 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  28.29 
 
 
409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0050  hypothetical protein  26.99 
 
 
448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00013841  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0463  hypothetical protein  26.95 
 
 
451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505363  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1706  hypothetical protein  26.7 
 
 
401 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1265  putative lipoprotein  25 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2969  hypothetical protein  25.66 
 
 
418 aa  97.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0451316  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0465  hypothetical protein  22.56 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.501265 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>