25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3869 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3869  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  788    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2701  hypothetical protein  45.45 
 
 
405 aa  324  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228985  normal  0.0970727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1225  hypothetical protein  39.35 
 
 
401 aa  236  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22049  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03863  hypothetical protein  37.16 
 
 
398 aa  225  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3313  putative lipoprotein  37.2 
 
 
411 aa  220  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.474661  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1068  putative lipoprotein  39.84 
 
 
423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1265  putative lipoprotein  39.79 
 
 
400 aa  209  6e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3303  hypothetical protein  34.93 
 
 
396 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00716702  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3233  hypothetical protein  33.93 
 
 
396 aa  206  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2655  hypothetical protein  34.03 
 
 
396 aa  206  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3185  hypothetical protein  33.42 
 
 
396 aa  206  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.624784  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  34.88 
 
 
400 aa  202  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1706  hypothetical protein  40.52 
 
 
401 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2414  putative lipoprotein  36.32 
 
 
410 aa  199  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0031  hypothetical protein  33.92 
 
 
408 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3536  putative lipoprotein  34.67 
 
 
406 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2969  hypothetical protein  39.29 
 
 
418 aa  189  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0451316  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03650  putative lipoprotein  35.03 
 
 
382 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  36.21 
 
 
409 aa  176  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0324  hypothetical protein  28.85 
 
 
472 aa  166  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2166  putative lipoprotein  28.41 
 
 
482 aa  156  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.843549  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0465  hypothetical protein  34.04 
 
 
329 aa  152  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0050  hypothetical protein  29.67 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00013841  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0463  hypothetical protein  29.49 
 
 
451 aa  113  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505363  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1099  hypothetical protein  22.46 
 
 
464 aa  44.3  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>