24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1706 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1706  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  798    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1265  putative lipoprotein  62.89 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2969  hypothetical protein  44.69 
 
 		 418 aa  263  4.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0451316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3869  hypothetical protein  40.38 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2701  hypothetical protein  36.13 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228985  normal  0.0970727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0639  hypothetical protein  34.98 
 
 		 400 aa  190  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03863  hypothetical protein  33.07 
 
 		 398 aa  189  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0031  hypothetical protein  35.7 
 
 		 408 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1068  putative lipoprotein  32.13 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3313  putative lipoprotein  31.75 
 
 		 411 aa  169  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.474661  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3185  hypothetical protein  33.09 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  32.9 
 
 		 409 aa  166  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3536  putative lipoprotein  33.86 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000150558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1225  hypothetical protein  34.9 
 
 		 401 aa  159  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22049  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3303  hypothetical protein  31.89 
 
 		 396 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00716702  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3233  hypothetical protein  31.41 
 
 		 396 aa  152  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2414  putative lipoprotein  32.11 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286985  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2655  hypothetical protein  33.25 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03650  putative lipoprotein  30.37 
 
 		 382 aa  137  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0050  hypothetical protein  27.23 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00013841  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0463  hypothetical protein  27.8 
 
 		 451 aa  130  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000505363  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0324  hypothetical protein  26.55 
 
 		 472 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0465  hypothetical protein  30.95 
 
 		 329 aa  96.3  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2166  putative lipoprotein  25.78 
 
 		 482 aa  89.7  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.843549  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>