More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2136 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2136  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
412 aa  852    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2291  peptidase M16 domain-containing protein  66.26 
 
 
440 aa  532  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2563  peptidase M16 domain protein  62.9 
 
 
428 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0239  M16 family peptidase  59.17 
 
 
419 aa  479  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0273  M16 family peptidase  59.37 
 
 
421 aa  463  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1953  peptidase M16 domain protein  52.35 
 
 
425 aa  410  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531871  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2188  peptidase M16 domain protein  49.75 
 
 
424 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.344972  normal  0.666529 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  39.56 
 
 
418 aa  308  8e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1507  peptidase M16 domain-containing protein  38.5 
 
 
451 aa  270  4e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.583967  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1594  M16 family peptidase  36.09 
 
 
418 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.326709  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3148  processing peptidase  36.62 
 
 
419 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  36.8 
 
 
418 aa  259  7e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1907  peptidase M16 domain-containing protein  34.78 
 
 
419 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0978353  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0235  M16 family peptidase  36.48 
 
 
421 aa  257  3e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0775  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  36.39 
 
 
421 aa  256  5e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1592  peptidase M16-like  36.64 
 
 
418 aa  256  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0267121  normal  0.0196738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4022  peptidase M16 domain-containing protein  34.22 
 
 
424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0571342 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  35.56 
 
 
466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3323  processing peptidase  36.27 
 
 
441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390474  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  35.68 
 
 
462 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  34.83 
 
 
432 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  35.59 
 
 
435 aa  252  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2975  peptidase M16 domain protein  34.89 
 
 
418 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000177641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1309  peptidase M16 domain protein  35.14 
 
 
418 aa  250  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00910612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  34.56 
 
 
424 aa  250  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14700  predicted Zn-dependent peptidase  36.32 
 
 
453 aa  249  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.2427  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  33.75 
 
 
413 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  34.88 
 
 
420 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2351  peptidase M16 domain-containing protein  34.15 
 
 
451 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472755 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1786  processing peptidase  35.89 
 
 
421 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.41523  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  33.83 
 
 
423 aa  247  3e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4314  peptidase M16 domain-containing protein  35.89 
 
 
421 aa  246  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518498  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  34.01 
 
 
413 aa  245  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  35.03 
 
 
412 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  35.21 
 
 
422 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1568  peptidase M16-like  34.84 
 
 
425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000011969  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2329  peptidase  34.79 
 
 
420 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124129  normal  0.969107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  34.47 
 
 
421 aa  243  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1147  processing peptidase  34.73 
 
 
426 aa  242  9e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  33.84 
 
 
413 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  33.59 
 
 
413 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  33.59 
 
 
413 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  33.59 
 
 
413 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  34.76 
 
 
429 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  33.59 
 
 
413 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  35.44 
 
 
422 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  33.59 
 
 
413 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  33.59 
 
 
413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  33.59 
 
 
413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1562  Zn-dependent peptidase  32.93 
 
 
419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000390885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  33.59 
 
 
413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7875  processing peptidase  33.42 
 
 
439 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0910  processing peptidase  32.68 
 
 
422 aa  239  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0721  peptidase M16 domain-containing protein  34.57 
 
 
421 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3480  peptidase M16 domain protein  34.78 
 
 
411 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0908  peptidase M16 domain protein  33.84 
 
 
429 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2147  peptidase M16 domain-containing protein  33.41 
 
 
429 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2101  peptidase M16-like protein  33.41 
 
 
429 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0527778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2084  peptidase M16 domain-containing protein  33.41 
 
 
429 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  34.2 
 
 
411 aa  237  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4796  peptidase M16-like  34.76 
 
 
429 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1419  processing peptidase  33 
 
 
424 aa  237  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3577  processing peptidase  34.83 
 
 
431 aa  235  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1440  peptidase M16 domain protein  34.68 
 
 
447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12795  zinc protease pepR  35.93 
 
 
438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3253  processing peptidase  34.83 
 
 
431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0840  putative zinc protease  35.18 
 
 
429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3449  processing peptidase  34.58 
 
 
431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847529  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1832  M16 family peptidase  35.06 
 
 
419 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1435  peptidase M16 domain-containing protein  34.38 
 
 
447 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0785  mitochondrial processing peptidase  33.83 
 
 
462 aa  233  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  33.9 
 
 
417 aa  232  7.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0175  M16 family peptidase  33.9 
 
 
423 aa  232  1e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0621  processing peptidase  34.54 
 
 
419 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2952  peptidase M16 domain protein  32.6 
 
 
430 aa  230  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0481  processing peptidase  34.81 
 
 
419 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0759  peptidase M16-like  34.31 
 
 
430 aa  229  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0050  peptidase M16 domain protein  34.64 
 
 
409 aa  229  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal  0.513919 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0691  peptidase M16 domain protein  35.24 
 
 
432 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0678  peptidase M16 domain-containing protein  33.87 
 
 
424 aa  229  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.614007  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1235  processing peptidase  30.92 
 
 
418 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  32.29 
 
 
438 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1074  peptidase family M16  33.5 
 
 
434 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3554  processing peptidase  34.24 
 
 
467 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106365  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  33.25 
 
 
399 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3582  peptidase M16 domain protein  34.71 
 
 
444 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2340  processing peptidase  31.88 
 
 
431 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.348853  normal  0.675898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0823  peptidase M16-like  33.5 
 
 
429 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2133  peptidase M16 domain protein  33.33 
 
 
436 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.765752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2477  peptidase M16 domain protein  33.98 
 
 
445 aa  225  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424609  normal  0.386088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3525  peptidase M16 domain-containing protein  32.66 
 
 
421 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.855558  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0535  processing peptidase  31.76 
 
 
434 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0230  peptidase M16  34.85 
 
 
429 aa  224  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1147  peptidase M16 domain protein  34.98 
 
 
420 aa  223  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2117  processing peptidase  32.59 
 
 
429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1444  processing peptidase  34.61 
 
 
421 aa  223  6e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5822  peptidase M16 domain protein  34.47 
 
 
461 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1190  peptidase M16 domain-containing protein  33.01 
 
 
477 aa  222  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0547363  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3234  processing peptidase  35.4 
 
 
421 aa  222  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0483  processing protease  32.67 
 
 
430 aa  222  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.678653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>