More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2329 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2329  peptidase  100 
 
 		 420 aa  852    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124129  normal  0.969107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3148  processing peptidase  72.14 
 
 		 419 aa  620  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0481  processing peptidase  71.43 
 
 		 419 aa  614  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1832  M16 family peptidase  71.67 
 
 		 419 aa  614  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0621  processing peptidase  70.24 
 
 		 419 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4314  peptidase M16 domain-containing protein  66.03 
 
 		 421 aa  570  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1147  processing peptidase  68.04 
 
 		 426 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0678  peptidase M16 domain-containing protein  51.48 
 
 		 424 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.614007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0721  peptidase M16 domain-containing protein  47.37 
 
 		 421 aa  385  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1074  peptidase family M16  45.8 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3234  processing peptidase  47.84 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0908  peptidase M16 domain protein  48.14 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0535  processing peptidase  45.91 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  47.77 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1786  processing peptidase  48.45 
 
 		 421 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.41523  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0823  peptidase M16-like  47.64 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0634  peptidase M16 domain protein  46.15 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1252  peptidase M16 domain protein  46.41 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4796  peptidase M16-like  46.65 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0269  peptidase M16 domain protein  46.68 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0691  peptidase M16 domain protein  45.19 
 
 		 432 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0488  zinc protease  45.21 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0964093  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0759  peptidase M16-like  44.1 
 
 		 430 aa  365  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0483  processing protease  44.72 
 
 		 430 aa  363  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.678653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0840  putative zinc protease  46.65 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2340  processing peptidase  45.54 
 
 		 431 aa  359  4e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.348853  normal  0.675898 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0598  processing peptidase  45.32 
 
 		 430 aa  358  8e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3253  processing peptidase  45.83 
 
 		 431 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529384 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0309  processing peptidase  47.26 
 
 		 421 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0115276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3577  processing peptidase  45.83 
 
 		 431 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0263  peptidase M16-like  45.91 
 
 		 429 aa  355  8.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.736782  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0230  peptidase M16  45.41 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3525  peptidase M16 domain-containing protein  45.68 
 
 		 421 aa  353  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.855558  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3449  processing peptidase  45.1 
 
 		 431 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0411  M16 family peptidase  42.47 
 
 		 422 aa  351  1e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.887609  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0235  M16 family peptidase  39.81 
 
 		 421 aa  346  3e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  42.05 
 
 		 423 aa  342  8e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1589  processing peptidase  45.41 
 
 		 431 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0398438 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0775  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  38.24 
 
 		 421 aa  322  9.999999999999999e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  38.35 
 
 		 424 aa  318  9e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  38.83 
 
 		 412 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  41.5 
 
 		 418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1414  processing peptidase  40.9 
 
 		 410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.186097 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3323  processing peptidase  40.58 
 
 		 441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390474  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  38.41 
 
 		 413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1594  M16 family peptidase  39.66 
 
 		 418 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.326709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  36.41 
 
 		 413 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  36.41 
 
 		 413 aa  302  9e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  36.41 
 
 		 413 aa  302  9e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  36.41 
 
 		 413 aa  302  9e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  36.65 
 
 		 413 aa  302  9e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  36.41 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  36.41 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  36.41 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  36.41 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0175  M16 family peptidase  38.96 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1592  peptidase M16-like  39.18 
 
 		 418 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0267121  normal  0.0196738 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  38.44 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  38.66 
 
 		 466 aa  294  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1568  peptidase M16-like  37.07 
 
 		 425 aa  293  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000011969  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  35.51 
 
 		 419 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  35.85 
 
 		 417 aa  290  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  35.93 
 
 		 399 aa  289  8e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3582  peptidase M16 domain protein  41.11 
 
 		 444 aa  287  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  37.89 
 
 		 462 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  37.77 
 
 		 435 aa  285  9e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20787  predicted protein  36.51 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0430146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1309  peptidase M16 domain protein  39.95 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00910612  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0785  mitochondrial processing peptidase  40.34 
 
 		 462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1907  peptidase M16 domain-containing protein  37.8 
 
 		 419 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0978353  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2351  peptidase M16 domain-containing protein  36.59 
 
 		 451 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1190  peptidase M16 domain-containing protein  37.16 
 
 		 477 aa  282  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0547363  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5822  peptidase M16 domain protein  39.76 
 
 		 461 aa  282  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2133  peptidase M16 domain protein  38.44 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.765752 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2975  peptidase M16 domain protein  39.51 
 
 		 418 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000177641 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  36.9 
 
 		 421 aa  280  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3176  peptidase M16 domain-containing protein  36.59 
 
 		 453 aa  280  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1562  Zn-dependent peptidase  36.14 
 
 		 419 aa  279  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000390885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  37.23 
 
 		 438 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  35.41 
 
 		 422 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  38.41 
 
 		 422 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  37.19 
 
 		 422 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1507  peptidase M16 domain-containing protein  36.41 
 
 		 451 aa  278  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.583967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  36.03 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  37.8 
 
 		 420 aa  276  4e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12795  zinc protease pepR  36.78 
 
 		 438 aa  276  5e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  33.09 
 
 		 411 aa  276  6e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14700  predicted Zn-dependent peptidase  37.26 
 
 		 453 aa  276  6e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.2427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1444  processing peptidase  38.08 
 
 		 421 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4497  peptidase M16 domain-containing protein  38.85 
 
 		 422 aa  272  7e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4022  peptidase M16 domain-containing protein  35.44 
 
 		 424 aa  272  7e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0571342 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1218  peptidase M16 domain protein  36.82 
 
 		 442 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.37886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  37.25 
 
 		 418 aa  272  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0910  processing peptidase  34.63 
 
 		 422 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7875  processing peptidase  35.63 
 
 		 439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3554  processing peptidase  36.08 
 
 		 467 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106365  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3953  peptidase M16 domain protein  37.47 
 
 		 459 aa  268  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870658  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2084  peptidase M16 domain-containing protein  34.63 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2101  peptidase M16-like protein  34.63 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0527778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2147  peptidase M16 domain-containing protein  34.63 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0966577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>