More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1190 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1190  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
477 aa  951    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0547363  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3554  processing peptidase  77.04 
 
 
467 aa  703    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106365  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  60.38 
 
 
435 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3323  processing peptidase  62.21 
 
 
441 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390474  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1507  peptidase M16 domain-containing protein  60.44 
 
 
451 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.583967  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2133  peptidase M16 domain protein  59.91 
 
 
436 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.765752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7875  processing peptidase  58.86 
 
 
439 aa  491  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  57.51 
 
 
466 aa  480  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  57.71 
 
 
462 aa  479  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3953  peptidase M16 domain protein  55.08 
 
 
459 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870658  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3176  peptidase M16 domain-containing protein  58.07 
 
 
453 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2477  peptidase M16 domain protein  54.93 
 
 
445 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424609  normal  0.386088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  54.35 
 
 
438 aa  451  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0785  mitochondrial processing peptidase  55.84 
 
 
462 aa  443  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3582  peptidase M16 domain protein  56.66 
 
 
444 aa  443  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1218  peptidase M16 domain protein  54.34 
 
 
442 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.37886  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1467  peptidase M16 domain protein  53.94 
 
 
457 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1519  peptidase M16 domain protein  52.82 
 
 
441 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5822  peptidase M16 domain protein  52.21 
 
 
461 aa  415  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2147  peptidase M16 domain-containing protein  50.74 
 
 
429 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2084  peptidase M16 domain-containing protein  50.74 
 
 
429 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2101  peptidase M16-like protein  50.74 
 
 
429 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0527778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1435  peptidase M16 domain-containing protein  50.6 
 
 
447 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2351  peptidase M16 domain-containing protein  50.24 
 
 
451 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472755 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23370  predicted Zn-dependent peptidase  51.68 
 
 
441 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0226628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14700  predicted Zn-dependent peptidase  50.6 
 
 
453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.2427  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4022  peptidase M16 domain-containing protein  49.75 
 
 
424 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0571342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1739  peptidase M16 domain protein  51.23 
 
 
443 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1026  processing peptidase  50.73 
 
 
439 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1440  peptidase M16 domain protein  50.36 
 
 
447 aa  398  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2222  peptidase M16 domain protein  48.87 
 
 
451 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000128075  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  45.74 
 
 
424 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12795  zinc protease pepR  49.63 
 
 
438 aa  385  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07110  predicted Zn-dependent peptidase  50.13 
 
 
439 aa  367  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.54818  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10390  predicted Zn-dependent peptidase  47.74 
 
 
446 aa  365  1e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0193865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  45.17 
 
 
422 aa  362  6e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  44.28 
 
 
421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  45.01 
 
 
422 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  46 
 
 
418 aa  348  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  41.63 
 
 
413 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  42.2 
 
 
413 aa  347  4e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  41.67 
 
 
420 aa  341  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  40.46 
 
 
411 aa  340  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  41.42 
 
 
413 aa  338  9e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  41.18 
 
 
413 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  41.18 
 
 
413 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  41.18 
 
 
413 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  41.18 
 
 
413 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  41.18 
 
 
413 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  41.18 
 
 
413 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  41.18 
 
 
413 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  40.93 
 
 
413 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  40.69 
 
 
412 aa  334  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  43.52 
 
 
418 aa  330  3e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  41.62 
 
 
399 aa  326  7e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  37.41 
 
 
417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3233  peptidase M16 domain protein  45.19 
 
 
426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  39.49 
 
 
419 aa  320  5e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1594  M16 family peptidase  38.5 
 
 
418 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.326709  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1568  peptidase M16-like  40 
 
 
425 aa  314  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000011969  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  39.06 
 
 
432 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0910  processing peptidase  36.01 
 
 
422 aa  312  9e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1419  processing peptidase  35.38 
 
 
424 aa  311  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1907  peptidase M16 domain-containing protein  38.95 
 
 
419 aa  310  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0978353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1309  peptidase M16 domain protein  40 
 
 
418 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00910612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2975  peptidase M16 domain protein  39.6 
 
 
418 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000177641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1562  Zn-dependent peptidase  37.65 
 
 
419 aa  306  7e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000390885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1235  processing peptidase  40.19 
 
 
418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  39.76 
 
 
422 aa  303  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  40.69 
 
 
429 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0678  peptidase M16 domain-containing protein  42.34 
 
 
424 aa  302  9e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.614007  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2117  processing peptidase  40.35 
 
 
429 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1592  peptidase M16-like  39.65 
 
 
418 aa  300  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0267121  normal  0.0196738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0823  peptidase M16-like  41.25 
 
 
429 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1444  processing peptidase  39.23 
 
 
421 aa  299  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0908  peptidase M16 domain protein  41.27 
 
 
429 aa  299  9e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3234  processing peptidase  42.14 
 
 
421 aa  296  7e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4796  peptidase M16-like  40.25 
 
 
429 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1147  processing peptidase  40.15 
 
 
426 aa  294  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0230  peptidase M16  41.37 
 
 
429 aa  289  9e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0263  peptidase M16-like  40.3 
 
 
429 aa  289  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.736782  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1786  processing peptidase  40.29 
 
 
421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.41523  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0397  peptidase M16 domain-containing protein  41.36 
 
 
431 aa  286  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  35.77 
 
 
423 aa  286  8e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0721  peptidase M16 domain-containing protein  39.51 
 
 
421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0309  processing peptidase  40.96 
 
 
421 aa  285  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0115276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0840  putative zinc protease  39 
 
 
429 aa  282  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  37.65 
 
 
423 aa  281  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1252  peptidase M16 domain protein  39.13 
 
 
421 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4314  peptidase M16 domain-containing protein  39.62 
 
 
421 aa  277  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518498  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3525  peptidase M16 domain-containing protein  40.53 
 
 
421 aa  276  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.855558  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1637  processing peptidase  33.17 
 
 
418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2329  peptidase  37.16 
 
 
420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124129  normal  0.969107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0269  peptidase M16 domain protein  39.95 
 
 
431 aa  274  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2340  processing peptidase  39.95 
 
 
431 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.348853  normal  0.675898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1074  peptidase family M16  38.39 
 
 
434 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1147  peptidase M16 domain-containing protein  39.12 
 
 
431 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0535  processing peptidase  38.24 
 
 
434 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1419  peptidase M16-like protein  40.39 
 
 
420 aa  266  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0503674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0483  processing protease  38.74 
 
 
430 aa  266  7e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.678653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>