More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1252 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1252  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
421 aa  845    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0721  peptidase M16 domain-containing protein  73.51 
 
 
421 aa  626  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0269  peptidase M16 domain protein  57.86 
 
 
431 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3525  peptidase M16 domain-containing protein  55.82 
 
 
421 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.855558  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2340  processing peptidase  55.74 
 
 
431 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.348853  normal  0.675898 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3577  processing peptidase  56.35 
 
 
431 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3253  processing peptidase  56.35 
 
 
431 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1589  processing peptidase  57.86 
 
 
431 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0398438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3449  processing peptidase  55.88 
 
 
431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847529  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0535  processing peptidase  54.88 
 
 
434 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0908  peptidase M16 domain protein  54.7 
 
 
429 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  54.21 
 
 
429 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1074  peptidase family M16  53.75 
 
 
434 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4796  peptidase M16-like  54.46 
 
 
429 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0823  peptidase M16-like  53.71 
 
 
429 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0488  zinc protease  50.24 
 
 
430 aa  425  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0964093  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0840  putative zinc protease  53.96 
 
 
429 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0263  peptidase M16-like  53.22 
 
 
429 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.736782  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0483  processing protease  49.41 
 
 
430 aa  420  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.678653  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0230  peptidase M16  53.71 
 
 
429 aa  420  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0598  processing peptidase  49.18 
 
 
430 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0691  peptidase M16 domain protein  52.8 
 
 
432 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0678  peptidase M16 domain-containing protein  51.89 
 
 
424 aa  413  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.614007  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0634  peptidase M16 domain protein  52.44 
 
 
432 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3234  processing peptidase  51.67 
 
 
421 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0759  peptidase M16-like  49.51 
 
 
430 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1786  processing peptidase  49.88 
 
 
421 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.41523  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0411  M16 family peptidase  46.42 
 
 
422 aa  390  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.887609  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0309  processing peptidase  47.78 
 
 
421 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0115276 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3148  processing peptidase  46.81 
 
 
419 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2329  peptidase  46.41 
 
 
420 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124129  normal  0.969107 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4314  peptidase M16 domain-containing protein  45.22 
 
 
421 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518498  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1832  M16 family peptidase  45.48 
 
 
419 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0481  processing peptidase  45 
 
 
419 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0621  processing peptidase  45 
 
 
419 aa  358  7e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0235  M16 family peptidase  39 
 
 
421 aa  351  1e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0775  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  38.63 
 
 
421 aa  350  3e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1147  processing peptidase  46.62 
 
 
426 aa  349  4e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  40.29 
 
 
424 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  37.86 
 
 
423 aa  323  3e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  40.1 
 
 
413 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  40.93 
 
 
418 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  38.42 
 
 
413 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  37.44 
 
 
413 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  37.19 
 
 
413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  37.19 
 
 
413 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  37.19 
 
 
413 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  37.19 
 
 
413 aa  306  7e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  37.19 
 
 
413 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  37.19 
 
 
413 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  37.19 
 
 
413 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  37.19 
 
 
413 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  37.19 
 
 
412 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  41.19 
 
 
420 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3323  processing peptidase  39.8 
 
 
441 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  38.75 
 
 
421 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  40.19 
 
 
435 aa  297  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  39.86 
 
 
438 aa  297  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  37.12 
 
 
399 aa  297  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4497  peptidase M16 domain-containing protein  41.46 
 
 
422 aa  296  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439835  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1519  peptidase M16 domain protein  39.52 
 
 
441 aa  294  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3953  peptidase M16 domain protein  40 
 
 
459 aa  294  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870658  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1507  peptidase M16 domain-containing protein  40.29 
 
 
451 aa  293  3e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.583967  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23370  predicted Zn-dependent peptidase  39.52 
 
 
441 aa  293  5e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0226628 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  37.5 
 
 
422 aa  292  9e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1218  peptidase M16 domain protein  40.14 
 
 
442 aa  291  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.37886  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1414  processing peptidase  39.7 
 
 
410 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.186097 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0175  M16 family peptidase  40.15 
 
 
423 aa  290  3e-77  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7875  processing peptidase  36.74 
 
 
439 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3582  peptidase M16 domain protein  40.48 
 
 
444 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  37.29 
 
 
419 aa  286  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  35.64 
 
 
411 aa  286  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1467  peptidase M16 domain protein  37.23 
 
 
457 aa  286  5.999999999999999e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1190  peptidase M16 domain-containing protein  39.37 
 
 
477 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0547363  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3554  processing peptidase  39.32 
 
 
467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106365  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2133  peptidase M16 domain protein  40.54 
 
 
436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.765752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1907  peptidase M16 domain-containing protein  37.13 
 
 
419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0978353  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1440  peptidase M16 domain protein  38.01 
 
 
447 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  37.38 
 
 
462 aa  281  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2477  peptidase M16 domain protein  37.86 
 
 
445 aa  281  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424609  normal  0.386088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  37.92 
 
 
466 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1026  processing peptidase  37.86 
 
 
439 aa  280  4e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2975  peptidase M16 domain protein  37.06 
 
 
418 aa  279  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000177641 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1444  processing peptidase  38.55 
 
 
421 aa  279  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1592  peptidase M16-like  37.43 
 
 
418 aa  279  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0267121  normal  0.0196738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0785  mitochondrial processing peptidase  39.51 
 
 
462 aa  278  9e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1568  peptidase M16-like  37.2 
 
 
425 aa  278  9e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000011969  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1309  peptidase M16 domain protein  37.06 
 
 
418 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00910612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1435  peptidase M16 domain-containing protein  38.01 
 
 
447 aa  277  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  37.28 
 
 
432 aa  276  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4022  peptidase M16 domain-containing protein  38.33 
 
 
424 aa  276  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0571342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2117  processing peptidase  39.43 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1637  processing peptidase  33.66 
 
 
418 aa  274  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3176  peptidase M16 domain-containing protein  39.36 
 
 
453 aa  274  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  37.35 
 
 
418 aa  273  6e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  34.81 
 
 
417 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20787  predicted protein  38.66 
 
 
473 aa  272  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0430146  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1594  M16 family peptidase  37.77 
 
 
418 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.326709  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2351  peptidase M16 domain-containing protein  36.41 
 
 
451 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472755 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0910  processing peptidase  37.78 
 
 
422 aa  268  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>