More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1026 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1026  processing peptidase  100 
 
 
439 aa  892    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23370  predicted Zn-dependent peptidase  68.19 
 
 
441 aa  591  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0226628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1218  peptidase M16 domain protein  67.35 
 
 
442 aa  581  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.37886  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1519  peptidase M16 domain protein  66.19 
 
 
441 aa  542  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2477  peptidase M16 domain protein  62.76 
 
 
445 aa  525  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424609  normal  0.386088 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1435  peptidase M16 domain-containing protein  59.4 
 
 
447 aa  521  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1440  peptidase M16 domain protein  59.4 
 
 
447 aa  509  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1467  peptidase M16 domain protein  60.37 
 
 
457 aa  501  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07110  predicted Zn-dependent peptidase  57.53 
 
 
439 aa  448  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.54818  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  51.17 
 
 
435 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  50.95 
 
 
462 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  50.24 
 
 
466 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7875  processing peptidase  49.06 
 
 
439 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2133  peptidase M16 domain protein  50.94 
 
 
436 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.765752 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1507  peptidase M16 domain-containing protein  52.47 
 
 
451 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.583967  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3323  processing peptidase  50.95 
 
 
441 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390474  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3554  processing peptidase  52.59 
 
 
467 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106365  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1190  peptidase M16 domain-containing protein  50.73 
 
 
477 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0547363  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10390  predicted Zn-dependent peptidase  49.77 
 
 
446 aa  395  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0193865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3582  peptidase M16 domain protein  49.08 
 
 
444 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3176  peptidase M16 domain-containing protein  50.24 
 
 
453 aa  385  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0785  mitochondrial processing peptidase  49.3 
 
 
462 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  47.23 
 
 
438 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14700  predicted Zn-dependent peptidase  48.55 
 
 
453 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.2427  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5822  peptidase M16 domain protein  48.35 
 
 
461 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3953  peptidase M16 domain protein  48.22 
 
 
459 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870658  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2084  peptidase M16 domain-containing protein  45.54 
 
 
429 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2101  peptidase M16-like protein  45.54 
 
 
429 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0527778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2147  peptidase M16 domain-containing protein  45.54 
 
 
429 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12795  zinc protease pepR  45.5 
 
 
438 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2351  peptidase M16 domain-containing protein  44.74 
 
 
451 aa  342  9e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4022  peptidase M16 domain-containing protein  44.07 
 
 
424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0571342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  40.73 
 
 
424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2222  peptidase M16 domain protein  44.03 
 
 
451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000128075  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1739  peptidase M16 domain protein  43.06 
 
 
443 aa  317  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  38.46 
 
 
413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  38.46 
 
 
413 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  38.46 
 
 
413 aa  309  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  38.46 
 
 
413 aa  309  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  38.46 
 
 
413 aa  309  8e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  38.46 
 
 
413 aa  309  8e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  38.46 
 
 
413 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  38.46 
 
 
413 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  37.04 
 
 
411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  38.21 
 
 
413 aa  306  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  41.04 
 
 
418 aa  307  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  41.09 
 
 
418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3233  peptidase M16 domain protein  42.89 
 
 
426 aa  303  5.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  39.1 
 
 
413 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2975  peptidase M16 domain protein  39.05 
 
 
418 aa  300  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000177641 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  41.16 
 
 
422 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  40.1 
 
 
420 aa  300  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  38.15 
 
 
413 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1235  processing peptidase  40.3 
 
 
418 aa  300  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1309  peptidase M16 domain protein  39.05 
 
 
418 aa  299  7e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00910612  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  39.36 
 
 
421 aa  299  8e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  37.66 
 
 
412 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  38.92 
 
 
399 aa  296  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  38.75 
 
 
422 aa  295  8e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  35.91 
 
 
419 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1568  peptidase M16-like  37.56 
 
 
425 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000011969  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0910  processing peptidase  35.89 
 
 
422 aa  291  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1592  peptidase M16-like  38.56 
 
 
418 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0267121  normal  0.0196738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1907  peptidase M16 domain-containing protein  37.97 
 
 
419 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0978353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  37.38 
 
 
432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1594  M16 family peptidase  36.72 
 
 
418 aa  279  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.326709  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  34.55 
 
 
417 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1562  Zn-dependent peptidase  38.14 
 
 
419 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000390885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  37.78 
 
 
429 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1252  peptidase M16 domain protein  37.38 
 
 
421 aa  270  5e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0823  peptidase M16-like  38.56 
 
 
429 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0908  peptidase M16 domain protein  37.81 
 
 
429 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0721  peptidase M16 domain-containing protein  38.98 
 
 
421 aa  269  8e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  35.59 
 
 
423 aa  265  1e-69  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  37.41 
 
 
422 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1444  processing peptidase  35.68 
 
 
421 aa  262  8.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0840  putative zinc protease  37.66 
 
 
429 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4796  peptidase M16-like  36.23 
 
 
429 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1419  peptidase M16-like protein  41.4 
 
 
420 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0503674  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0269  peptidase M16 domain protein  38.16 
 
 
431 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0263  peptidase M16-like  36.48 
 
 
429 aa  256  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.736782  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1786  processing peptidase  36.01 
 
 
421 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.41523  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0230  peptidase M16  37.06 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1147  processing peptidase  36.78 
 
 
426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0678  peptidase M16 domain-containing protein  36.77 
 
 
424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.614007  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3234  processing peptidase  38.01 
 
 
421 aa  254  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3148  processing peptidase  37.76 
 
 
419 aa  254  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2329  peptidase  36.07 
 
 
420 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124129  normal  0.969107 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4314  peptidase M16 domain-containing protein  36.32 
 
 
421 aa  249  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518498  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0483  processing protease  36.59 
 
 
430 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.678653  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1419  processing peptidase  29.13 
 
 
424 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0037  processing peptidase  34.59 
 
 
424 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0309  processing peptidase  36.74 
 
 
421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0115276 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1074  peptidase family M16  35.01 
 
 
434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1637  processing peptidase  30.36 
 
 
418 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0488  zinc protease  36.09 
 
 
430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0964093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2340  processing peptidase  37.05 
 
 
431 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.348853  normal  0.675898 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0535  processing peptidase  34.42 
 
 
434 aa  242  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0481  processing peptidase  35.7 
 
 
419 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2117  processing peptidase  34.49 
 
 
429 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>