More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2975 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1309  peptidase M16 domain protein  98.33 
 
 
418 aa  847    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00910612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1907  peptidase M16 domain-containing protein  72.25 
 
 
419 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0978353  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2975  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
418 aa  858    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000177641 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1592  peptidase M16-like  68.72 
 
 
418 aa  596  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0267121  normal  0.0196738 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1594  M16 family peptidase  63.46 
 
 
418 aa  578  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.326709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2117  processing peptidase  56.27 
 
 
429 aa  475  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1839  processing peptidase  51.45 
 
 
432 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.814022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1562  Zn-dependent peptidase  49.28 
 
 
419 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000390885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1235  processing peptidase  47.55 
 
 
418 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3667  peptidase M16 domain protein  44.85 
 
 
424 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1059  peptidase M16-like  45.3 
 
 
421 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0076042  hitchhiker  0.00221195 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  44.8 
 
 
420 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2056  peptidase M16 domain protein  45.27 
 
 
413 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1163  processing peptidase  44.53 
 
 
413 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0385172  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1653  peptidase M16 domain protein  44.44 
 
 
418 aa  364  2e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3564  zinc protease  44.85 
 
 
413 aa  363  4e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3627  peptidase M16 domain-containing protein  44.85 
 
 
413 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3816  zinc protease, insulinase family  44.85 
 
 
413 aa  362  6e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3903  zinc protease, insulinase family  44.85 
 
 
413 aa  362  6e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.141801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3656  zinc protease  44.85 
 
 
413 aa  362  6e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.200109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3546  zinc protease  44.85 
 
 
413 aa  362  6e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3852  zinc protease, insulinase family  44.85 
 
 
413 aa  362  6e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000305728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3942  zinc protease  44.85 
 
 
413 aa  362  6e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1568  peptidase M16-like  44.09 
 
 
425 aa  362  6e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000011969  decreased coverage  0.00224891 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3843  zinc protease  44.85 
 
 
413 aa  362  8e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2457  peptidase M16 domain-containing protein  43.54 
 
 
412 aa  360  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0190406  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1706  peptidase M16 domain protein  41.52 
 
 
411 aa  359  5e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.425033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3177  peptidase M16 domain protein  43.32 
 
 
422 aa  348  8e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.56337  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1341  zinc protease, insulinase family  44.77 
 
 
399 aa  346  5e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.411991 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1382  peptidase M16 domain-containing protein  42.34 
 
 
466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.975318  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7875  processing peptidase  43.78 
 
 
439 aa  342  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1444  processing peptidase  41.67 
 
 
421 aa  342  5.999999999999999e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.422023  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1340  peptidase M16 domain-containing protein  41.43 
 
 
462 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3323  processing peptidase  42.31 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390474  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  41.69 
 
 
418 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1453  peptidase M16 domain protein  39.31 
 
 
417 aa  334  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.093065 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1947  peptidase M16 domain-containing protein  41.04 
 
 
422 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000141516  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1507  peptidase M16 domain-containing protein  41.43 
 
 
451 aa  330  2e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.583967  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0785  mitochondrial processing peptidase  42.75 
 
 
462 aa  329  7e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0419  peptidase M16-like protein  39.56 
 
 
419 aa  325  6e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0910  processing peptidase  39.26 
 
 
422 aa  324  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1467  peptidase M16 domain protein  40.8 
 
 
457 aa  323  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0037  processing peptidase  41.12 
 
 
424 aa  322  8e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3953  peptidase M16 domain protein  42.39 
 
 
459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.870658  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3554  processing peptidase  41.23 
 
 
467 aa  317  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.106365  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1069  peptidase M16 domain-containing protein  38.69 
 
 
435 aa  317  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.421262  hitchhiker  0.00357472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0678  peptidase M16 domain-containing protein  41.98 
 
 
424 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.614007  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2477  peptidase M16 domain protein  40.48 
 
 
445 aa  315  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424609  normal  0.386088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5111  peptidase M16 domain-containing protein  38.5 
 
 
438 aa  312  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591794  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14700  predicted Zn-dependent peptidase  40.75 
 
 
453 aa  312  9e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.2427  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4022  peptidase M16 domain-containing protein  39.55 
 
 
424 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0571342 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1637  processing peptidase  35.68 
 
 
418 aa  310  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1435  peptidase M16 domain-containing protein  38.96 
 
 
447 aa  310  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3582  peptidase M16 domain protein  41.04 
 
 
444 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2351  peptidase M16 domain-containing protein  39.05 
 
 
451 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1190  peptidase M16 domain-containing protein  39.6 
 
 
477 aa  306  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0547363  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1419  processing peptidase  36.02 
 
 
424 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12795  zinc protease pepR  39.9 
 
 
438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1440  peptidase M16 domain protein  38.64 
 
 
447 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000448085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1147  processing peptidase  40.5 
 
 
426 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23370  predicted Zn-dependent peptidase  39.21 
 
 
441 aa  301  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0226628 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1026  processing peptidase  39.05 
 
 
439 aa  300  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1218  peptidase M16 domain protein  38.42 
 
 
442 aa  298  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.37886  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2101  peptidase M16-like protein  37.53 
 
 
429 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0527778  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3233  peptidase M16 domain protein  39.41 
 
 
426 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3176  peptidase M16 domain-containing protein  39.45 
 
 
453 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2084  peptidase M16 domain-containing protein  37.53 
 
 
429 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2147  peptidase M16 domain-containing protein  37.53 
 
 
429 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5822  peptidase M16 domain protein  41.19 
 
 
461 aa  298  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1519  peptidase M16 domain protein  40.15 
 
 
441 aa  297  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1511  peptidase M16 domain protein  38.62 
 
 
424 aa  293  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1786  processing peptidase  38.92 
 
 
421 aa  292  6e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.41523  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3148  processing peptidase  43.88 
 
 
419 aa  292  7e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  0.591857 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07110  predicted Zn-dependent peptidase  40.37 
 
 
439 aa  292  9e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.54818  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4577  peptidase M16-like  37.66 
 
 
429 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4796  peptidase M16-like  35.48 
 
 
429 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0908  peptidase M16 domain protein  37.41 
 
 
429 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2133  peptidase M16 domain protein  38.93 
 
 
436 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.765752 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3234  processing peptidase  39.95 
 
 
421 aa  290  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0481  processing peptidase  41.41 
 
 
419 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130826  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1832  M16 family peptidase  41.41 
 
 
419 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2730  peptidase M16 domain protein  38.11 
 
 
424 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.584644  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0621  processing peptidase  40.89 
 
 
419 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4314  peptidase M16 domain-containing protein  39.04 
 
 
421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518498  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  36.67 
 
 
422 aa  282  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0840  putative zinc protease  36.95 
 
 
429 aa  282  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0309  processing peptidase  39.01 
 
 
421 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0115276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3525  peptidase M16 domain-containing protein  37.38 
 
 
421 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.855558  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0397  peptidase M16 domain-containing protein  35.41 
 
 
431 aa  280  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0535  processing peptidase  37.59 
 
 
434 aa  280  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0823  peptidase M16-like  35.43 
 
 
429 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1739  peptidase M16 domain protein  37.31 
 
 
443 aa  278  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2222  peptidase M16 domain protein  36.63 
 
 
451 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000128075  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1074  peptidase family M16  38.02 
 
 
434 aa  276  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1252  peptidase M16 domain protein  37.06 
 
 
421 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0721  peptidase M16 domain-containing protein  39.56 
 
 
421 aa  274  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.257658 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0488  zinc protease  35.42 
 
 
430 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0964093  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0483  processing protease  35.58 
 
 
430 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.678653  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2329  peptidase  39.61 
 
 
420 aa  273  5.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124129  normal  0.969107 
 
 
-
 
NC_002978  WD0737  M16 family peptidase putative  35.37 
 
 
423 aa  272  7e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>