More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1251 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1327  argininosuccinate lyase  71.93 
 
 
466 aa  681    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1367  argininosuccinate lyase  78.91 
 
 
460 aa  754    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1043  argininosuccinate lyase  75 
 
 
461 aa  724    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0730  argininosuccinate lyase  77.68 
 
 
461 aa  739    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.410396  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1251  argininosuccinate lyase  100 
 
 
463 aa  949    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1047  argininosuccinate lyase  76.15 
 
 
460 aa  721    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00526091  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1327  argininosuccinate lyase  79.87 
 
 
468 aa  738    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.456779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  51.55 
 
 
462 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  51.77 
 
 
462 aa  478  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  50.99 
 
 
462 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  51.77 
 
 
462 aa  481  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  51.66 
 
 
463 aa  480  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  51.55 
 
 
462 aa  479  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  51.77 
 
 
462 aa  481  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  51.55 
 
 
462 aa  478  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  51.66 
 
 
463 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  51.33 
 
 
462 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  51.55 
 
 
462 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  51.66 
 
 
481 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  52.1 
 
 
459 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  49.01 
 
 
461 aa  457  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  48.67 
 
 
458 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  47.78 
 
 
461 aa  448  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  48.12 
 
 
458 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  48.57 
 
 
464 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  49.77 
 
 
467 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  47.24 
 
 
460 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  48.01 
 
 
458 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  47.92 
 
 
462 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  48.7 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  47.24 
 
 
461 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  46.19 
 
 
462 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  47.35 
 
 
464 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  46.04 
 
 
458 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  47.79 
 
 
464 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  46.19 
 
 
462 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  46.65 
 
 
462 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  47.06 
 
 
464 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  46.51 
 
 
458 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  46.58 
 
 
466 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  47.28 
 
 
464 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  49.23 
 
 
475 aa  432  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  46.9 
 
 
466 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  46.78 
 
 
467 aa  429  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  47.35 
 
 
468 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  47.02 
 
 
467 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  46.19 
 
 
464 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  46.74 
 
 
459 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  46.74 
 
 
459 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  46.41 
 
 
464 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  47.35 
 
 
464 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  45.81 
 
 
458 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  46.84 
 
 
499 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  45.49 
 
 
459 aa  430  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  46.52 
 
 
463 aa  426  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  45.97 
 
 
464 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1044  argininosuccinate lyase  46.78 
 
 
461 aa  428  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  46.9 
 
 
456 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  46.41 
 
 
464 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  45.03 
 
 
458 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  47.46 
 
 
478 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00111  argininosuccinate lyase  47.09 
 
 
463 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.642056  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1339  argininosuccinate lyase  47.31 
 
 
463 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00111  argininosuccinate lyase  46.26 
 
 
459 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.24061  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1072  argininosuccinate lyase  46.78 
 
 
461 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000143666  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  47.07 
 
 
462 aa  422  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  45.7 
 
 
459 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  45.69 
 
 
464 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  45.37 
 
 
458 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1261  argininosuccinate lyase  46.78 
 
 
461 aa  421  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000476291  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  47.6 
 
 
469 aa  418  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  45.7 
 
 
461 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2475  argininosuccinate lyase  45.71 
 
 
474 aa  421  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124507 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  47.01 
 
 
459 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00121  argininosuccinate lyase  46.09 
 
 
462 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.669318  hitchhiker  0.00196346 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0123  argininosuccinate lyase  45.65 
 
 
459 aa  419  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.001821  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  47.19 
 
 
465 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  45.95 
 
 
462 aa  418  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  47.27 
 
 
441 aa  415  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  45.35 
 
 
467 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  45.89 
 
 
462 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  47.39 
 
 
466 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  44.37 
 
 
458 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  45.8 
 
 
468 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  46.33 
 
 
466 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  44.44 
 
 
491 aa  413  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  45.7 
 
 
461 aa  414  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0013  argininosuccinate lyase  47.2 
 
 
472 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  46.78 
 
 
465 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1050  argininosuccinate lyase  46.97 
 
 
463 aa  414  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  45.27 
 
 
463 aa  413  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00121  argininosuccinate lyase  47.31 
 
 
470 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2530  argininosuccinate lyase  45.7 
 
 
460 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  48.58 
 
 
441 aa  411  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  46.56 
 
 
468 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  45.02 
 
 
459 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  46.4 
 
 
463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0013  argininosuccinate lyase  47.09 
 
 
476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1781  argininosuccinate lyase  44.9 
 
 
479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  45.35 
 
 
469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>