More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1339 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_00111  argininosuccinate lyase  99.14 
 
 
463 aa  934    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.642056  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1339  argininosuccinate lyase  100 
 
 
463 aa  941    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0013  argininosuccinate lyase  69.38 
 
 
476 aa  642    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0013  argininosuccinate lyase  68.57 
 
 
472 aa  644    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00121  argininosuccinate lyase  70.83 
 
 
470 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00121  argininosuccinate lyase  70.02 
 
 
462 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.669318  hitchhiker  0.00196346 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00111  argininosuccinate lyase  63.76 
 
 
459 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.24061  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00111  argininosuccinate lyase  61.71 
 
 
459 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  64.89 
 
 
462 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  64.62 
 
 
462 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  65.05 
 
 
462 aa  606  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  64.62 
 
 
462 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00111  argininosuccinate lyase  61.57 
 
 
459 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0012  argininosuccinate lyase  61.35 
 
 
459 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526131  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2475  argininosuccinate lyase  63.7 
 
 
474 aa  601  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  62.64 
 
 
463 aa  598  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2754  argininosuccinate lyase  62.88 
 
 
467 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  63.74 
 
 
461 aa  597  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  53.78 
 
 
462 aa  511  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  53.78 
 
 
462 aa  512  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  54 
 
 
463 aa  511  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  54 
 
 
462 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  53.78 
 
 
462 aa  512  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  54.22 
 
 
462 aa  514  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  54.22 
 
 
463 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  54.44 
 
 
462 aa  512  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  53.78 
 
 
462 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  54 
 
 
462 aa  511  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  53.56 
 
 
462 aa  508  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  54.15 
 
 
481 aa  498  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  54 
 
 
459 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  52.13 
 
 
459 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  52.31 
 
 
464 aa  468  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  51.86 
 
 
478 aa  467  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  52.11 
 
 
468 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  51.21 
 
 
458 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
459 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 
458 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
456 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1361  argininosuccinate lyase  50 
 
 
465 aa  461  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
460 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  49.23 
 
 
491 aa  458  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
461 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
459 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  49.34 
 
 
461 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  50.23 
 
 
458 aa  457  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  51.09 
 
 
475 aa  456  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1111  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
467 aa  458  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.552146 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  49.23 
 
 
462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2664  argininosuccinate lyase  46.68 
 
 
486 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
458 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3312  argininosuccinate lyase  46.68 
 
 
486 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.401423  normal  0.113313 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 
468 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1949  argininosuccinate lyase  46.47 
 
 
485 aa  448  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789721  decreased coverage  0.00358351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
458 aa  450  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  51.35 
 
 
467 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 
467 aa  451  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  49.01 
 
 
462 aa  450  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 
461 aa  449  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  48.79 
 
 
458 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  48.46 
 
 
461 aa  448  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  47.92 
 
 
459 aa  450  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
464 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  48.68 
 
 
458 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  49.01 
 
 
458 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  48.57 
 
 
457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 
459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  48.34 
 
 
457 aa  444  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  48.33 
 
 
458 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  49.23 
 
 
469 aa  442  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 
464 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 
464 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  48.35 
 
 
466 aa  441  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
465 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  49.77 
 
 
459 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  50.45 
 
 
469 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  48.9 
 
 
464 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1047  argininosuccinate lyase  46.85 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00526091  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  48.44 
 
 
466 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3091  argininosuccinate lyase  46.62 
 
 
476 aa  438  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5316  argininosuccinate lyase  46.25 
 
 
493 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32969  normal  0.657667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 
464 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0730  argininosuccinate lyase  48.34 
 
 
461 aa  437  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.410396  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  50.71 
 
 
441 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1354  argininosuccinate lyase  46.74 
 
 
488 aa  438  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.295924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  47.93 
 
 
464 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  50.57 
 
 
463 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3672  argininosuccinate lyase  46.88 
 
 
469 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3415  argininosuccinate lyase  48.26 
 
 
468 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2183  argininosuccinate lyase  49.22 
 
 
468 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.013453 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  48.11 
 
 
460 aa  432  1e-120  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0865  argininosuccinate lyase  48.78 
 
 
489 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348748  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3681  argininosuccinate lyase  47.85 
 
 
462 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  48.78 
 
 
469 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1710  argininosuccinate lyase  46.3 
 
 
483 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2991  argininosuccinate lyase  48.78 
 
 
469 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>