More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0464 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  68.94 
 
 
457 aa  639    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  68.94 
 
 
457 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  68.94 
 
 
457 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  68.94 
 
 
457 aa  639    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0464  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  100 
 
 
645 aa  1330    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3713  argininosuccinate lyase  68.72 
 
 
455 aa  647    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0260  argininosuccinate lyase  68.87 
 
 
456 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  60.66 
 
 
624 aa  784    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  68.72 
 
 
457 aa  635    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0231  argininosuccinate lyase  70.64 
 
 
456 aa  666    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4209  argininosuccinate lyase  68.06 
 
 
455 aa  644    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  60.5 
 
 
624 aa  781    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  68.72 
 
 
457 aa  636    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0966471 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  59.4 
 
 
624 aa  765    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  68.94 
 
 
457 aa  639    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0254  argininosuccinate lyase  69.09 
 
 
455 aa  649    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4120  argininosuccinate lyase  68.06 
 
 
455 aa  644    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0195  argininosuccinate lyase  68.06 
 
 
476 aa  644    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  68.72 
 
 
457 aa  637    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4272  argininosuccinate lyase  70.24 
 
 
457 aa  651    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0333  argininosuccinate lyase  70.2 
 
 
456 aa  642    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0232  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  57.52 
 
 
626 aa  743    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0376427  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2217  argininosuccinate lyase  70.26 
 
 
458 aa  642    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  68.89 
 
 
457 aa  633  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4091  argininosuccinate lyase  68.28 
 
 
455 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4010  argininosuccinate lyase  68.06 
 
 
455 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4026  argininosuccinate lyase  68.5 
 
 
457 aa  631  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4778  argininosuccinate lyase  67.77 
 
 
457 aa  630  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4451  argininosuccinate lyase  68.82 
 
 
458 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102786 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4333  argininosuccinate lyase  68.82 
 
 
458 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4454  argininosuccinate lyase  68.82 
 
 
458 aa  625  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000120209 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4364  argininosuccinate lyase  68.6 
 
 
458 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4528  argininosuccinate lyase  68.6 
 
 
458 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4249  argininosuccinate lyase  68.22 
 
 
457 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.951659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3896  argininosuccinate lyase  66.96 
 
 
457 aa  616  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0279  argininosuccinate lyase  68.13 
 
 
455 aa  615  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0129  argininosuccinate lyase  66.96 
 
 
457 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4087  argininosuccinate lyase  66.96 
 
 
457 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0206  argininosuccinate lyase  70.67 
 
 
453 aa  618  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4058  argininosuccinate lyase  68 
 
 
457 aa  617  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3705  argininosuccinate lyase  68.35 
 
 
455 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.597621  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3901  argininosuccinate lyase  67.99 
 
 
455 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.150944 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0240  argininosuccinate lyase  67.77 
 
 
455 aa  611  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3917  argininosuccinate lyase  68.22 
 
 
457 aa  610  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0197  argininosuccinate lyase  67.78 
 
 
457 aa  608  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0692  argininosuccinate lyase  62.67 
 
 
457 aa  591  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.611653  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00528  argininosuccinate lyase  59.69 
 
 
460 aa  551  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0978  argininosuccinate lyase  58.81 
 
 
458 aa  535  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 
458 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  50.57 
 
 
441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  51.35 
 
 
441 aa  451  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  49.22 
 
 
456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  48.68 
 
 
459 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  48.59 
 
 
462 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  47.87 
 
 
466 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  47.9 
 
 
460 aa  439  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  48.88 
 
 
462 aa  437  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  48.16 
 
 
462 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  50.45 
 
 
459 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  48.16 
 
 
462 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  48.88 
 
 
462 aa  438  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  48.88 
 
 
462 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  48.65 
 
 
468 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  48.66 
 
 
463 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  48.12 
 
 
461 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  48.67 
 
 
464 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  48.88 
 
 
463 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  48.44 
 
 
464 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  48.1 
 
 
462 aa  435  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  49.1 
 
 
464 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  48.77 
 
 
464 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  48.65 
 
 
499 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  48.55 
 
 
464 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  48.25 
 
 
460 aa  433  1e-120  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  48.16 
 
 
462 aa  435  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  47.14 
 
 
463 aa  429  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  48.43 
 
 
464 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
468 aa  432  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  47.99 
 
 
462 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2490  argininosuccinate lyase  48.77 
 
 
466 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5489  argininosuccinate lyase  47.67 
 
 
464 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  46.37 
 
 
461 aa  428  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
464 aa  428  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  48.1 
 
 
464 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  46.54 
 
 
462 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  47.14 
 
 
458 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  49.11 
 
 
463 aa  425  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  47.43 
 
 
464 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  46.64 
 
 
459 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  46.64 
 
 
459 aa  421  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  48.55 
 
 
491 aa  420  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  47.24 
 
 
475 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  47.75 
 
 
463 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  47.87 
 
 
459 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  47.36 
 
 
458 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  47.36 
 
 
458 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  48.21 
 
 
459 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  47.09 
 
 
466 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  50.22 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  47.62 
 
 
469 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>