More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0978 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0978  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 458 aa  941    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00528  argininosuccinate lyase  75.72 
 
 		 460 aa  721    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0260  argininosuccinate lyase  60.53 
 
 		 456 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0231  argininosuccinate lyase  59.03 
 
 		 456 aa  551  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3713  argininosuccinate lyase  58.81 
 
 		 455 aa  551  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4209  argininosuccinate lyase  58.81 
 
 		 455 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4120  argininosuccinate lyase  58.81 
 
 		 455 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4778  argininosuccinate lyase  58.72 
 
 		 457 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0129  argininosuccinate lyase  59.25 
 
 		 457 aa  545  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4087  argininosuccinate lyase  59.25 
 
 		 457 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3896  argininosuccinate lyase  59.25 
 
 		 457 aa  545  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0195  argininosuccinate lyase  58.59 
 
 		 476 aa  543  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4451  argininosuccinate lyase  58.59 
 
 		 458 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102786 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4272  argininosuccinate lyase  58.46 
 
 		 457 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4364  argininosuccinate lyase  58.55 
 
 		 458 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4010  argininosuccinate lyase  58.59 
 
 		 455 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0254  argininosuccinate lyase  57.84 
 
 		 455 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  58.37 
 
 		 457 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0966471 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  58.15 
 
 		 457 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  58.15 
 
 		 457 aa  538  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0464  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  58.81 
 
 		 645 aa  535  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  57.96 
 
 		 624 aa  535  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4091  argininosuccinate lyase  58.37 
 
 		 455 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4528  argininosuccinate lyase  58.15 
 
 		 458 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4333  argininosuccinate lyase  58.11 
 
 		 458 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  58.15 
 
 		 457 aa  538  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  58.15 
 
 		 457 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  58.15 
 
 		 457 aa  538  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  57.77 
 
 		 457 aa  535  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4454  argininosuccinate lyase  58.33 
 
 		 458 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000120209 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  58.37 
 
 		 457 aa  537  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0333  argininosuccinate lyase  58.86 
 
 		 456 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0232  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  58.81 
 
 		 626 aa  536  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0376427  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0279  argininosuccinate lyase  59.03 
 
 		 455 aa  531  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4026  argininosuccinate lyase  58.15 
 
 		 457 aa  534  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  58.15 
 
 		 457 aa  534  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3705  argininosuccinate lyase  59.25 
 
 		 455 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.597621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  57.96 
 
 		 624 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0197  argininosuccinate lyase  59.82 
 
 		 457 aa  529  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4249  argininosuccinate lyase  58.94 
 
 		 457 aa  528  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.951659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  57.74 
 
 		 624 aa  530  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3917  argininosuccinate lyase  59.82 
 
 		 457 aa  528  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0206  argininosuccinate lyase  60 
 
 		 453 aa  529  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0240  argininosuccinate lyase  58.72 
 
 		 455 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4058  argininosuccinate lyase  58.94 
 
 		 457 aa  528  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3901  argininosuccinate lyase  58.94 
 
 		 455 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150944 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2217  argininosuccinate lyase  59.08 
 
 		 458 aa  526  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0692  argininosuccinate lyase  54.7 
 
 		 457 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.611653  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  54.82 
 
 		 441 aa  481  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  50.66 
 
 		 459 aa  472  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 		 458 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  48.46 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  48.55 
 
 		 461 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  46.94 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  47.81 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  47.66 
 
 		 462 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  48.01 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  47.81 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  47.59 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  47.59 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  50.33 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  47.59 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  47.59 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  47.79 
 
 		 463 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  48.56 
 
 		 459 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  47.79 
 
 		 463 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  48.76 
 
 		 459 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  46.51 
 
 		 462 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  47.59 
 
 		 462 aa  435  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  47.15 
 
 		 441 aa  433  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  48.12 
 
 		 458 aa  428  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  48.46 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  47.67 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  48.12 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  48.34 
 
 		 481 aa  428  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  46.58 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  47.56 
 
 		 461 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  46.68 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  48.34 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  48.97 
 
 		 463 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  49.2 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  48.97 
 
 		 459 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  48.89 
 
 		 464 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  48.97 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  47.35 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  44.49 
 
 		 466 aa  425  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  46.7 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  49.22 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  46.56 
 
 		 458 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2338  argininosuccinate lyase  49.21 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  48.78 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  46.89 
 
 		 459 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  46.24 
 
 		 458 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  46.56 
 
 		 461 aa  421  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  48.46 
 
 		 475 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  46.89 
 
 		 459 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  45.68 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  47.37 
 
 		 491 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0065  argininosuccinate lyase  47.56 
 
 		 464 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  49.66 
 
 		 467 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>