More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0206 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0464  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  70.67 
 
 		 645 aa  660    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4010  argininosuccinate lyase  79.87 
 
 		 455 aa  744    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0279  argininosuccinate lyase  79.65 
 
 		 455 aa  724    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  68.82 
 
 		 624 aa  636    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  67.99 
 
 		 624 aa  635    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4091  argininosuccinate lyase  79.65 
 
 		 455 aa  742    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3713  argininosuccinate lyase  80.53 
 
 		 455 aa  761    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0333  argininosuccinate lyase  87.39 
 
 		 456 aa  803    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4272  argininosuccinate lyase  87.17 
 
 		 457 aa  808    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0206  argininosuccinate lyase  100 
 
 		 453 aa  928    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0231  argininosuccinate lyase  85.18 
 
 		 456 aa  810    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0254  argininosuccinate lyase  79.65 
 
 		 455 aa  759    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4120  argininosuccinate lyase  80.09 
 
 		 455 aa  759    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  68.6 
 
 		 624 aa  636    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4209  argininosuccinate lyase  80.09 
 
 		 455 aa  759    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3705  argininosuccinate lyase  79.65 
 
 		 455 aa  725    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.597621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0240  argininosuccinate lyase  79.42 
 
 		 455 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0195  argininosuccinate lyase  79.87 
 
 		 476 aa  758    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3901  argininosuccinate lyase  79.42 
 
 		 455 aa  724    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0260  argininosuccinate lyase  75.66 
 
 		 456 aa  711    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4778  argininosuccinate lyase  68.29 
 
 		 457 aa  630  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4528  argininosuccinate lyase  69.04 
 
 		 458 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4454  argininosuccinate lyase  69.04 
 
 		 458 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000120209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  68.67 
 
 		 457 aa  624  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0966471 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4364  argininosuccinate lyase  68.82 
 
 		 458 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4451  argininosuccinate lyase  69.04 
 
 		 458 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102786 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  68.44 
 
 		 457 aa  624  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  68.44 
 
 		 457 aa  624  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  68.44 
 
 		 457 aa  621  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  68.44 
 
 		 457 aa  624  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4087  argininosuccinate lyase  68.89 
 
 		 457 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  68.44 
 
 		 457 aa  624  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  68.67 
 
 		 457 aa  624  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  68.44 
 
 		 457 aa  624  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0232  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  66.15 
 
 		 626 aa  621  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0376427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4333  argininosuccinate lyase  68.82 
 
 		 458 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  68.44 
 
 		 457 aa  622  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3896  argininosuccinate lyase  68.89 
 
 		 457 aa  622  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0129  argininosuccinate lyase  68.89 
 
 		 457 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4026  argininosuccinate lyase  68.22 
 
 		 457 aa  620  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4058  argininosuccinate lyase  68.89 
 
 		 457 aa  614  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3917  argininosuccinate lyase  68.89 
 
 		 457 aa  616  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4249  argininosuccinate lyase  68.89 
 
 		 457 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.951659  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0197  argininosuccinate lyase  68.22 
 
 		 457 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2217  argininosuccinate lyase  67.93 
 
 		 458 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0692  argininosuccinate lyase  61.78 
 
 		 457 aa  584  1.0000000000000001e-165  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.611653  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0978  argininosuccinate lyase  60 
 
 		 458 aa  557  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00528  argininosuccinate lyase  57.02 
 
 		 460 aa  526  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  49.22 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 		 459 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  49.66 
 
 		 441 aa  466  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  53.4 
 
 		 441 aa  464  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  49.44 
 
 		 456 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 		 460 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  46.99 
 
 		 462 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  50.34 
 
 		 459 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  48.23 
 
 		 462 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  49.66 
 
 		 458 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  48.23 
 
 		 462 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  46.55 
 
 		 466 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  47.79 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  48.01 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  48.87 
 
 		 462 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  47.79 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  48.33 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  47.79 
 
 		 462 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  48.01 
 
 		 462 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  47.79 
 
 		 463 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  47.79 
 
 		 463 aa  443  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  47.35 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  50.67 
 
 		 468 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  47.1 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  47.99 
 
 		 458 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  48.76 
 
 		 467 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  49.67 
 
 		 475 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  46.98 
 
 		 462 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  49.66 
 
 		 469 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  50.55 
 
 		 478 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  49.11 
 
 		 466 aa  435  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  48.32 
 
 		 458 aa  433  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  48.66 
 
 		 481 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  47.49 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  45.19 
 
 		 460 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  48.43 
 
 		 469 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1050  argininosuccinate lyase  48.06 
 
 		 463 aa  432  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  48.88 
 
 		 491 aa  433  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1458  argininosuccinate lyase  48.57 
 
 		 460 aa  435  1e-120  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  47.1 
 
 		 458 aa  433  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  46.85 
 
 		 458 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  48.43 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  48.32 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  47.22 
 
 		 461 aa  430  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  48.42 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  48.66 
 
 		 468 aa  428  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  47.87 
 
 		 462 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  46.98 
 
 		 459 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  46.43 
 
 		 471 aa  427  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  45.52 
 
 		 459 aa  428  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  47.87 
 
 		 462 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  46.88 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>