More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3705 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3713  argininosuccinate lyase  93.39 
 
 
455 aa  873    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0464  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  68.35 
 
 
645 aa  646    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0279  argininosuccinate lyase  98.9 
 
 
455 aa  922    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0260  argininosuccinate lyase  78.15 
 
 
456 aa  732    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4209  argininosuccinate lyase  94.05 
 
 
455 aa  878    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0206  argininosuccinate lyase  79.65 
 
 
453 aa  716    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0231  argininosuccinate lyase  78.59 
 
 
456 aa  748    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4010  argininosuccinate lyase  93.39 
 
 
455 aa  855    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4091  argininosuccinate lyase  93.83 
 
 
455 aa  857    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0254  argininosuccinate lyase  85.21 
 
 
455 aa  802    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0333  argininosuccinate lyase  79.91 
 
 
456 aa  739    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4120  argininosuccinate lyase  94.27 
 
 
455 aa  880    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3705  argininosuccinate lyase  100 
 
 
455 aa  930    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.597621  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0240  argininosuccinate lyase  97.79 
 
 
455 aa  909    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0195  argininosuccinate lyase  86.34 
 
 
476 aa  811    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4272  argininosuccinate lyase  79.3 
 
 
457 aa  737    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.507417 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3901  argininosuccinate lyase  99.12 
 
 
455 aa  920    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.150944 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2710  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  68.35 
 
 
624 aa  633  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  67.48 
 
 
624 aa  624  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00040  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  67.04 
 
 
624 aa  621  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0232  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  66.15 
 
 
626 aa  621  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0376427  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2217  argininosuccinate lyase  67.18 
 
 
458 aa  619  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03845  argininosuccinate lyase  66.3 
 
 
457 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4026  argininosuccinate lyase  66.3 
 
 
457 aa  615  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03794  hypothetical protein  66.3 
 
 
457 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4194  argininosuccinate lyase  66.3 
 
 
457 aa  615  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4056  argininosuccinate lyase  66.3 
 
 
457 aa  615  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4364  argininosuccinate lyase  66.82 
 
 
458 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4528  argininosuccinate lyase  67.04 
 
 
458 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.260421  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4454  argininosuccinate lyase  67.04 
 
 
458 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000120209 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4026  argininosuccinate lyase  66.67 
 
 
457 aa  612  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4451  argininosuccinate lyase  67.04 
 
 
458 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102786 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4446  argininosuccinate lyase  66.3 
 
 
457 aa  612  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5420  argininosuccinate lyase  66.67 
 
 
457 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4499  argininosuccinate lyase  66.3 
 
 
457 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.512894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4407  argininosuccinate lyase  66.3 
 
 
457 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0966471 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4778  argininosuccinate lyase  66.08 
 
 
457 aa  609  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4087  argininosuccinate lyase  65.86 
 
 
457 aa  607  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3896  argininosuccinate lyase  65.86 
 
 
457 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0129  argininosuccinate lyase  65.86 
 
 
457 aa  606  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4333  argininosuccinate lyase  66.59 
 
 
458 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3917  argininosuccinate lyase  66.89 
 
 
457 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0197  argininosuccinate lyase  66.89 
 
 
457 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4249  argininosuccinate lyase  65.78 
 
 
457 aa  598  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.951659  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4058  argininosuccinate lyase  65.33 
 
 
457 aa  597  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0692  argininosuccinate lyase  61.11 
 
 
457 aa  574  1.0000000000000001e-162  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.611653  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0978  argininosuccinate lyase  59.25 
 
 
458 aa  551  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00528  argininosuccinate lyase  58.13 
 
 
460 aa  537  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  51 
 
 
460 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  49 
 
 
459 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  48.33 
 
 
458 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  49.89 
 
 
441 aa  457  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  53.32 
 
 
441 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  51.43 
 
 
475 aa  448  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  50 
 
 
458 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  48.99 
 
 
456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  50.44 
 
 
468 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  46.77 
 
 
462 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3006  argininosuccinate lyase  46.55 
 
 
462 aa  437  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365153  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  50.23 
 
 
467 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  47.87 
 
 
462 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  48.32 
 
 
462 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  48.1 
 
 
462 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  48.55 
 
 
462 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  47.87 
 
 
462 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  48.57 
 
 
458 aa  435  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  48.1 
 
 
462 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  48.1 
 
 
463 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  48.32 
 
 
463 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  46.12 
 
 
461 aa  429  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  48.1 
 
 
462 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  50.23 
 
 
459 aa  429  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  47.87 
 
 
462 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  48.1 
 
 
462 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  47.87 
 
 
458 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  47.66 
 
 
461 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  47.02 
 
 
458 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  45.65 
 
 
460 aa  427  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0015  argininosuccinate lyase  49.56 
 
 
478 aa  428  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1050  argininosuccinate lyase  48.32 
 
 
463 aa  427  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0682  argininosuccinate lyase  44.81 
 
 
466 aa  428  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  47.8 
 
 
458 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  48.03 
 
 
458 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0229  argininosuccinate lyase  51.13 
 
 
463 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  49.45 
 
 
491 aa  423  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  47.87 
 
 
461 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
462 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  49.12 
 
 
469 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3590  argininosuccinate lyase  48.45 
 
 
466 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
462 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  48.98 
 
 
469 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  46.36 
 
 
458 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0180  argininosuccinate lyase  47.54 
 
 
471 aa  420  1e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  49.1 
 
 
467 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  48.66 
 
 
457 aa  421  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  45.41 
 
 
461 aa  419  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  48.44 
 
 
457 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0110  argininosuccinate lyase  47.87 
 
 
462 aa  415  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  47.98 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  47.44 
 
 
464 aa  418  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>