More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2076 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2076  sensor histidine kinase VncS  100 
 
 		 439 aa  847    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0315771  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0617  sensor histidine kinase VncS  69.48 
 
 		 439 aa  595  1e-169  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2423  histidine kinase  25.21 
 
 		 490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3208  sensor protein vanSB  29.79 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2750  histidine kinase, putative  29.74 
 
 		 495 aa  114  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0186571  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2181  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 507 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.547096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 479 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0122916 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 490 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1892  sensor histidine kinase  30.45 
 
 		 507 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5470  histidine kinase  27.69 
 
 		 467 aa  106  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0102378  hitchhiker  0.00183313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 525 aa  99.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.62366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 499 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0256  sensor histidine kinase  27.78 
 
 		 615 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1385  histidine kinase  26.76 
 
 		 603 aa  93.6  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.643671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1753  histidine kinase  24.23 
 
 		 578 aa  93.2  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4645  histidine kinase  27 
 
 		 620 aa  92.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2892  sensor histidine kinase SrrB, putative  29.9 
 
 		 458 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000807575  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  26.47 
 
 		 603 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  26.47 
 
 		 603 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1371  sensor histidine kinase  26.47 
 
 		 603 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1344  sensor histidine kinase  26.47 
 
 		 603 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1343  sensor histidine kinase  26.47 
 
 		 603 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.830761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1482  sensor histidine kinase  26.47 
 
 		 603 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1554  sensor histidine kinase  26.47 
 
 		 603 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1517  sensor histidine kinase  26.76 
 
 		 604 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4545  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 617 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3828  sensor histidine kinase  26.76 
 
 		 604 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000117767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2367  putative sensor histidine kinase SrrB  29.56 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2589  sensor histidine kinase  28.53 
 
 		 468 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2866  putative sensor histidine kinase SrrB  28.53 
 
 		 458 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000772439 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2668  sensor histidine kinase SrrB  28.53 
 
 		 458 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2861  sensor histidine kinase SrrB  28.53 
 
 		 458 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.933521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4563  sensor histidine kinase  26.64 
 
 		 617 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4706  sensory box histidine kinase  26.3 
 
 		 617 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468527  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  26.9 
 
 		 468 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.82 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2914  histidine kinase  25 
 
 		 520 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.705646  normal  0.368156 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5067  sensory box histidine kinase  26.3 
 
 		 617 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4931  sensory box histidine kinase  25.95 
 
 		 617 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 601 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2876  putative sensor histidine kinase SrrB  28.83 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2620  sensor histidine kinase  28.62 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2665  histidine kinase  26.81 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2475  histidine kinase  23.36 
 
 		 472 aa  84  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186434 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2158  histidine kinase  26.73 
 
 		 536 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0596427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4860  histidine kinase  26.15 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2909  putative sensor histidine kinase SrrB  28.47 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4936  sensory box histidine kinase  26.3 
 
 		 617 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4901  sensor histidine kinase  27.18 
 
 		 480 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5276  sensor histidine kinase  27.18 
 
 		 480 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5145  sensor histidine kinase  26.86 
 
 		 480 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5174  sensor histidine kinase  27.18 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4745  sensor histidine kinase  26.86 
 
 		 480 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4764  sensor histidine kinase  26.54 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5189  sensor histidine kinase  27.18 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0070  sensor histidine kinase  27.48 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5180  sensor protein vanSB  27.48 
 
 		 480 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4968  sensory box histidine kinase  25.95 
 
 		 609 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0303  sensory box histidine kinase  25.95 
 
 		 616 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  26.52 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 		 640 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4951  sensory box histidine kinase  26.46 
 
 		 617 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  22.12 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  26.54 
 
 		 482 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2355  sensor histidine kinase  26.58 
 
 		 482 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3178  sensory box histidine kinase VicK, putative  25.9 
 
 		 615 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111783  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 		 487 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  20.18 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1954  sensor histidine kinase  24.62 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2910  histidine kinase  23.08 
 
 		 594 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1085  histidine kinase  28.33 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.25 
 
 		 639 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  19.96 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  19.96 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 		 639 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  23.79 
 
 		 465 aa  74.3  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0323  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 		 706 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.976803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3618  histidine kinase  24.39 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00141174  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  32.32 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 495 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2432  ATPase domain-containing protein  24.04 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.870833  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 		 493 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  27.12 
 
 		 454 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181714  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  24.32 
 
 		 482 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  22.15 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  20.66 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 641 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  20.79 
 
 		 460 aa  71.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  25.4 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  21.68 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0588  Signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132026  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.42 
 
 		 639 aa  70.5  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>