More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2854 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
499 aa  1021    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2914  histidine kinase  38.89 
 
 
520 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.705646  normal  0.368156 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  37.43 
 
 
603 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  37.04 
 
 
603 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1371  sensor histidine kinase  39.24 
 
 
603 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1344  sensor histidine kinase  37.43 
 
 
603 aa  243  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1343  sensor histidine kinase  37.43 
 
 
603 aa  243  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.830761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1482  sensor histidine kinase  39.24 
 
 
603 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1554  sensor histidine kinase  37.43 
 
 
603 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192618 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2158  histidine kinase  37.15 
 
 
536 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0596427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
601 aa  240  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1385  histidine kinase  36.83 
 
 
603 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.643671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1517  sensor histidine kinase  36.75 
 
 
604 aa  239  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3828  sensor histidine kinase  36.83 
 
 
604 aa  239  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000117767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2181  sensor histidine kinase  37.76 
 
 
507 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.547096  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1892  sensor histidine kinase  38.05 
 
 
507 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
490 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2423  histidine kinase  29.09 
 
 
490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0256  sensor histidine kinase  32.84 
 
 
615 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1132  histidine kinase  33.33 
 
 
458 aa  194  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4951  sensory box histidine kinase  32.04 
 
 
617 aa  191  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2750  histidine kinase, putative  28.28 
 
 
495 aa  190  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0186571  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5470  histidine kinase  29.47 
 
 
467 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0102378  hitchhiker  0.00183313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4936  sensory box histidine kinase  32.44 
 
 
617 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4645  histidine kinase  32.04 
 
 
620 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4563  sensor histidine kinase  31.74 
 
 
617 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 
479 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0122916 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4931  sensory box histidine kinase  31.44 
 
 
617 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4706  sensory box histidine kinase  31.44 
 
 
617 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5067  sensory box histidine kinase  31.44 
 
 
617 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4545  sensor histidine kinase  31.74 
 
 
617 aa  187  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0303  sensory box histidine kinase  31.74 
 
 
616 aa  186  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3178  sensory box histidine kinase VicK, putative  32.24 
 
 
615 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2910  histidine kinase  31.44 
 
 
594 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4968  sensory box histidine kinase  31.14 
 
 
609 aa  183  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
493 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0247  histidine kinase  26.76 
 
 
488 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.60943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
487 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
432 aa  160  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000747291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
590 aa  160  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  31.33 
 
 
463 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1753  histidine kinase  29.82 
 
 
578 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
597 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  30.33 
 
 
462 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0169  histidine kinase  29.71 
 
 
465 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  30.67 
 
 
463 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
462 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  30.53 
 
 
496 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  31.16 
 
 
461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  29.67 
 
 
456 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
473 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  30.82 
 
 
463 aa  153  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
604 aa  153  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  31.16 
 
 
463 aa  153  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  31.16 
 
 
463 aa  153  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  30.23 
 
 
463 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
597 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
462 aa  150  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  34.31 
 
 
352 aa  150  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  29.33 
 
 
463 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  29.01 
 
 
508 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  31.89 
 
 
466 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  31.89 
 
 
466 aa  147  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  31.89 
 
 
466 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  31.89 
 
 
466 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  31.89 
 
 
466 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
470 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  31.27 
 
 
467 aa  146  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  31.89 
 
 
466 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  31.89 
 
 
466 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  30.69 
 
 
455 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  30.69 
 
 
455 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
468 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  32.89 
 
 
466 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  29.06 
 
 
468 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  32.89 
 
 
466 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
504 aa  144  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  32.12 
 
 
466 aa  143  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
429 aa  143  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  33.47 
 
 
537 aa  143  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2876  putative sensor histidine kinase SrrB  31.25 
 
 
458 aa  143  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
589 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2866  putative sensor histidine kinase SrrB  30.19 
 
 
458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000772439 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3041  two-component sensor histidine kinase, phosphate regulation  29.33 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.575064  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2668  sensor histidine kinase SrrB  30.19 
 
 
458 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2861  sensor histidine kinase SrrB  30.19 
 
 
458 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.933521  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1893  histidine kinase  32.19 
 
 
545 aa  141  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00596145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2367  putative sensor histidine kinase SrrB  30.65 
 
 
458 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
581 aa  141  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5610  histidine kinase  28.02 
 
 
344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741974  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 
382 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
464 aa  140  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0498  histidine kinase  30.43 
 
 
487 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3401  histidine kinase  28.49 
 
 
361 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.810153  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
597 aa  139  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2589  sensor histidine kinase  29.56 
 
 
468 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>