More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN01660 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_10393  hypothetical protein similar to isoleucine/valine tRNA synthetase (Broad)  39.24 
 
 
1000 aa  674    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105138  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01660  isoleucyl-tRNA synthetase, mitochondrial, putative  100 
 
 
1032 aa  2140    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3774  isoleucyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
978 aa  682    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5054  isoleucyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
959 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.211178 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2060  isoleucyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
973 aa  655    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
974 aa  644    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5054  isoleucyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
960 aa  673    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2437  isoleucyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
954 aa  679    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.202511  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17198  predicted protein  37.97 
 
 
1052 aa  653    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.847126  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2707  isoleucyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
959 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24331  isoleucyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
1370 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3396  isoleucyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 
959 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.375781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3586  isoleucyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
1152 aa  691    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3114  isoleucyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 
955 aa  699    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782266  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63933  isoleucine-tRNA ligase  35.78 
 
 
983 aa  635  1e-180  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.946751  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1605  isoleucyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
967 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0410688  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03171  isoleucyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 
967 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02701  isoleucyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
965 aa  625  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.21788  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02611  isoleucyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 
969 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.771851  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45389  predicted protein  38.25 
 
 
949 aa  622  1e-177  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000425012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
919 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1468  isoleucyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
920 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02601  isoleucyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
968 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02591  isoleucyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 
968 aa  608  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0240  isoleucyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 
968 aa  601  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
921 aa  589  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1909  isoleucyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 
924 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09270  isoleucyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 
929 aa  592  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.157511  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 
921 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
921 aa  587  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3996  isoleucyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 
921 aa  589  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000796155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3947  isoleucyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
921 aa  588  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000642844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3722  isoleucyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
921 aa  587  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3909  isoleucyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
921 aa  588  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000211806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1245  isoleucyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
921 aa  586  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00257705  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1039  isoleucyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
923 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
921 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
921 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
931 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1349  isoleucyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
920 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1020  isoleucyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
916 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2544  isoleucyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 
921 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1094  isoleucyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 
928 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 
916 aa  573  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3938  isoleucyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
926 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1855  isoleucyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
929 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.552413  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1320  Isoleucyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 
926 aa  575  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0985  isoleucyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 
927 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1408  isoleucyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
930 aa  571  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0026312  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1425  isoleucyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 
913 aa  567  1e-160  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1118  isoleucyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 
938 aa  569  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00413581  normal  0.0891258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 
931 aa  569  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
930 aa  567  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 
927 aa  566  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1277  isoleucyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 
917 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1252  isoleucyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 
917 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4041  isoleucyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 
922 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00112426  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1089  isoleucyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 
927 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000209628  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1889  isoleucyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 
923 aa  562  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 
928 aa  562  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl389  isoleucyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
908 aa  556  1e-157  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0675614  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0906  isoleucyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 
921 aa  557  1e-157  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1886  isoleucyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 
932 aa  558  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0954369  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0775  isoleucyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
937 aa  557  1e-157  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1626  isoleucyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 
919 aa  558  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235357  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1196  isoleucyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 
944 aa  556  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1087  isoleucyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
939 aa  555  1e-156  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 
908 aa  554  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1191  isoleucyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 
929 aa  553  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.723642  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2056  isoleucyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
932 aa  554  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0393  isoleucyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
908 aa  551  1e-155  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.658478  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0598  isoleucyl-tRNA synthetase  34 
 
 
960 aa  550  1e-155  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000596981  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4559  isoleucyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 
943 aa  549  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.349463  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0649  isoleucyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
943 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.159001 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf589  isoleucyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
889 aa  549  1e-154  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000236104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 
927 aa  546  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
923 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 
943 aa  545  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0644  isoleucyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 
943 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 
941 aa  546  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 
954 aa  545  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0454  isoleucyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 
900 aa  540  9.999999999999999e-153  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.45707  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 
924 aa  536  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0977  isoleucyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
919 aa  539  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0266  isoleucyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 
938 aa  537  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0463751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0953  isoleucyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 
943 aa  537  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.344865 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
939 aa  534  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 
941 aa  534  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 
940 aa  533  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3650  isoleucyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
925 aa  534  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000233753  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3216  isoleucyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 
937 aa  535  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5200  isoleucyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 
943 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11780  isoleucyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 
943 aa  529  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.125013  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
923 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1194  isoleucyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
940 aa  532  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000135641  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1125  isoleucyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
943 aa  529  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
938 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 
943 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1083  isoleucyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 
940 aa  532  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.234482  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0488  isoleucyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 
936 aa  530  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.502083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>