More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0598 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3450  isoleucyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 959 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.132168  normal  0.319354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 938 aa  729    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 938 aa  728    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 924 aa  763    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 923 aa  762    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 943 aa  714    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 916 aa  1034    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 939 aa  730    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02591  isoleucyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 968 aa  689    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 		 921 aa  1101    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 953 aa  707    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24331  isoleucyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 1370 aa  724    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0485  isoleucyl-tRNA synthetase  58.05 
 
 		 930 aa  1144    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02601  isoleucyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 968 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 940 aa  692    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0806  isoleucyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 943 aa  704    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  56.23 
 
 		 921 aa  1100    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  56.23 
 
 		 921 aa  1098    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl389  isoleucyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 908 aa  796    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0675614  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 		 921 aa  1103    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2242  isoleucyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 945 aa  656    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03171  isoleucyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 967 aa  726    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0999  isoleucyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 931 aa  720    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0968  isoleucyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 931 aa  721    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 938 aa  764    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0710  isoleucyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 943 aa  707    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0257753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 941 aa  716    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 932 aa  725    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1605  isoleucyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 967 aa  728    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0410688  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45389  predicted protein  41.73 
 
 		 949 aa  709    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000425012  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 944 aa  721    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 929 aa  738    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0584  isoleucyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 948 aa  701    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3774  isoleucyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 978 aa  750    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1122  isoleucyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 945 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02701  isoleucyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 965 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.21788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 940 aa  721    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4852  isoleucyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 943 aa  697    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 940 aa  683    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 927 aa  775    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5844  isoleucyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 945 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2060  isoleucyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 973 aa  735    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 974 aa  729    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 923 aa  750    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 934 aa  744    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 943 aa  739    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  56.23 
 
 		 921 aa  1100    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 		 931 aa  931    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0240  isoleucyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 968 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251122  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2437  isoleucyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 954 aa  747    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.202511  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 943 aa  736    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0393  isoleucyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 908 aa  759    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.658478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0971  isoleucyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 945 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.581767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 930 aa  922    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0770  isoleucyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 945 aa  656    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 946 aa  694    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3046  isoleucyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 946 aa  653    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3399  isoleucyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 951 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.93279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 940 aa  698    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2658  isoleucyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 945 aa  656    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.763386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1432  isoleucyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 		 975 aa  653    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 932 aa  732    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2112  isoleucyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 945 aa  656    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2208  isoleucyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 934 aa  695    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3849  isoleucyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 943 aa  653    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.471166  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0953  isoleucyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 943 aa  687    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.344865 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 943 aa  695    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3612  isoleucyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 987 aa  641    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0967  isoleucyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 945 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0481  isoleucyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 946 aa  681    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 941 aa  757    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 947 aa  722    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 940 aa  698    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 938 aa  678    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1861  isoleucyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 936 aa  756    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1033  isoleucyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 945 aa  656    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3229  isoleucyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 944 aa  647    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1901  isoleucyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 945 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.580041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 942 aa  722    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1059  isoleucyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 940 aa  682    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131865  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 		 937 aa  703    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3586  isoleucyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 1152 aa  747    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 940 aa  689    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 940 aa  693    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 941 aa  747    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 943 aa  706    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 927 aa  929    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 931 aa  915    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2559  isoleucyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 945 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 943 aa  696    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2056  isoleucyl-tRNA synthetase  58.55 
 
 		 932 aa  1139    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1139  isoleucyl-tRNA synthetase  58.2 
 
 		 921 aa  1128    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.357484  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1196  isoleucyl-tRNA synthetase  60.28 
 
 		 944 aa  1173    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1487  isoleucyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 		 930 aa  1120    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0783  isoleucyl-tRNA synthetase  59.01 
 
 		 929 aa  1162    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2512  isoleucyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 945 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0334302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 939 aa  724    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 928 aa  794    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 954 aa  745    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 940 aa  690    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>