More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0240 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0013  isoleucyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
947 aa  696    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
938 aa  714    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
938 aa  713    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
924 aa  749    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
923 aa  742    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
943 aa  663    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  44 
 
 
916 aa  791    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
939 aa  701    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
940 aa  749    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
921 aa  809    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
953 aa  694    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02591  isoleucyl-tRNA synthetase  92.05 
 
 
968 aa  1835    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0485  isoleucyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
930 aa  714    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02601  isoleucyl-tRNA synthetase  91.11 
 
 
968 aa  1808    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 
940 aa  715    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0806  isoleucyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
943 aa  652    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
921 aa  809    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
921 aa  810    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0953  isoleucyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
943 aa  654    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.344865 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
921 aa  810    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1277  isoleucyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 
917 aa  806    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
941 aa  731    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0999  isoleucyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
931 aa  707    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0968  isoleucyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
931 aa  701    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1425  isoleucyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
913 aa  737    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0710  isoleucyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
943 aa  650    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0257753  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
941 aa  704    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
932 aa  657    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1605  isoleucyl-tRNA synthetase  62.83 
 
 
967 aa  1259    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0410688  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1059  isoleucyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
940 aa  723    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 
939 aa  690    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
929 aa  654    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1121  isoleucyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
940 aa  721    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3774  isoleucyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
978 aa  1093    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0598  isoleucyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 
960 aa  715    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000596981  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0214  isoleucyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 
949 aa  721    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000786038  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
940 aa  712    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4852  isoleucyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
943 aa  647    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1892  isoleucyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
946 aa  683    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
927 aa  748    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3460  isoleucyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
938 aa  659    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011793  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2060  isoleucyl-tRNA synthetase  59.05 
 
 
973 aa  1231    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  59.75 
 
 
974 aa  1229    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
923 aa  749    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
934 aa  696    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
943 aa  719    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
921 aa  809    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
919 aa  756    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0240  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
968 aa  2001    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251122  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2437  isoleucyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 
954 aa  1113    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.202511  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 
943 aa  686    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45389  predicted protein  48 
 
 
949 aa  909    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000425012  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2966  isoleucyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
940 aa  650    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.828678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 
930 aa  810    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5054  isoleucyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 
960 aa  1101    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  38.47 
 
 
946 aa  686    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5200  isoleucyl-tRNA synthetase  37.46 
 
 
943 aa  656    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
908 aa  731    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1252  isoleucyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 
917 aa  806    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
931 aa  798    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2544  isoleucyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
921 aa  811    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
932 aa  714    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0644  isoleucyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
943 aa  661    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2208  isoleucyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
934 aa  637    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
931 aa  835    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0807  isoleucyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
945 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
943 aa  713    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
944 aa  725    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02701  isoleucyl-tRNA synthetase  80.58 
 
 
965 aa  1613    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.21788  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0481  isoleucyl-tRNA synthetase  37.51 
 
 
946 aa  660    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03171  isoleucyl-tRNA synthetase  62.03 
 
 
967 aa  1256    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
947 aa  707    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4313  isoleucyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
924 aa  737    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.375273  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
938 aa  677    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1861  isoleucyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
936 aa  680    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4230  isoleucyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
940 aa  692    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0354153  hitchhiker  0.0000563381 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
938 aa  689    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0287  isoleucyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 
965 aa  655    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.547871 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
942 aa  695    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
940 aa  722    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
937 aa  715    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3586  isoleucyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 
1152 aa  1096    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
940 aa  705    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
940 aa  706    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
941 aa  724    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
943 aa  724    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
927 aa  803    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24331  isoleucyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 
1370 aa  1259    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2559  isoleucyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 
945 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
943 aa  651    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2056  isoleucyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
932 aa  739    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1139  isoleucyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
921 aa  688    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.357484  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1196  isoleucyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
944 aa  683    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1487  isoleucyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
930 aa  687    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0783  isoleucyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
929 aa  710    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1672  isoleucyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
936 aa  721    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.232615  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
940 aa  719    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
928 aa  732    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 
954 aa  707    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
940 aa  708    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>