More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0393 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4313  isoleucyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 924 aa  663    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.375273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 924 aa  661    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 923 aa  655    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 916 aa  834    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3757  isoleucyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 925 aa  643    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0454  isoleucyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 900 aa  712    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.45707  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 921 aa  822    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3396  isoleucyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 959 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.375781 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0485  isoleucyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 930 aa  719    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 931 aa  731    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1277  isoleucyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 917 aa  817    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 921 aa  823    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 921 aa  823    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl389  isoleucyl-tRNA synthetase  66.19 
 
 		 908 aa  1289    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0675614  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 921 aa  822    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1626  isoleucyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 919 aa  678    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235357  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1118  isoleucyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 938 aa  651    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00413581  normal  0.0891258 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0985  isoleucyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 927 aa  663    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3947  isoleucyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 921 aa  822    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000642844  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1320  Isoleucyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 926 aa  746    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1039  isoleucyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 923 aa  840    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185965  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2707  isoleucyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 959 aa  675    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3774  isoleucyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 978 aa  650    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1094  isoleucyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 928 aa  698    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2544  isoleucyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 921 aa  841    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5054  isoleucyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 959 aa  668    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.211178 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4041  isoleucyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 922 aa  736    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00112426  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3114  isoleucyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 955 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 927 aa  678    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1083  isoleucyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 940 aa  639    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.234482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1089  isoleucyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 927 aa  714    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000209628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 923 aa  667    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1087  isoleucyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 939 aa  651    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1468  isoleucyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 920 aa  703    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 921 aa  823    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1349  isoleucyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 920 aa  727    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2437  isoleucyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 954 aa  681    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.202511  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3650  isoleucyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 925 aa  651    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000233753  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0393  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 908 aa  1866    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.658478  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 930 aa  750    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 908 aa  674    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5054  isoleucyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 960 aa  645    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1245  isoleucyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 921 aa  829    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00257705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 931 aa  759    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3909  isoleucyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 921 aa  823    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000211806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1886  isoleucyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 932 aa  699    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0954369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3996  isoleucyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 921 aa  827    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000796155  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0598  isoleucyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 960 aa  759    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000596981  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09270  isoleucyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 929 aa  761    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.157511  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1408  isoleucyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 930 aa  724    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0026312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1252  isoleucyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 917 aa  817    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 919 aa  701    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3938  isoleucyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 926 aa  715    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3722  isoleucyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 921 aa  828    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119148  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 937 aa  647    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3586  isoleucyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 1152 aa  637    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 927 aa  741    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1909  isoleucyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 924 aa  814    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1425  isoleucyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 913 aa  702    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0981  isoleucyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 924 aa  638    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2056  isoleucyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 932 aa  744    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1139  isoleucyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 921 aa  681    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.357484  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1196  isoleucyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 944 aa  807    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1487  isoleucyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 930 aa  703    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0783  isoleucyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 929 aa  748    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17198  predicted protein  37.26 
 
 		 1052 aa  653    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.847126  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 928 aa  686    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf589  isoleucyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 889 aa  788    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000236104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1855  isoleucyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 929 aa  748    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.552413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1020  isoleucyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 916 aa  666    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 		 946 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1892  isoleucyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 946 aa  629  1e-179  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 		 946 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115196  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 		 940 aa  630  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0488  isoleucyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 936 aa  629  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.502083  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1557  isoleucyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 		 948 aa  630  1e-179  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0128152 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 940 aa  630  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1889  isoleucyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 923 aa  628  1e-178  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1291  isoleucyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 		 940 aa  627  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326353  normal  0.133319 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 974 aa  625  1e-178  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1191  isoleucyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 929 aa  629  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.723642  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 946 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0013  isoleucyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 947 aa  629  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 938 aa  624  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 938 aa  623  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0028  isoleucyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 938 aa  622  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0184357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0026  isoleucyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 938 aa  623  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000276203  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3629  isoleucyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 938 aa  623  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0030  isoleucyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 938 aa  622  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000755713  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00029  hypothetical protein  37.24 
 
 		 938 aa  624  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00165877  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 		 947 aa  624  1e-177  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1194  isoleucyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 		 940 aa  625  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 941 aa  625  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 943 aa  624  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06340  isoleucyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 948 aa  619  1e-176  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.951905  normal  0.158712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 940 aa  622  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1144  isoleucyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 942 aa  619  1e-176  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.946837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1605  isoleucyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 967 aa  621  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0410688  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 932 aa  621  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24331  isoleucyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 1370 aa  621  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>