More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1139 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 938 aa  683    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 938 aa  677    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 938 aa  675    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 924 aa  706    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 923 aa  692    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0024  isoleucyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 938 aa  677    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0199251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 916 aa  929    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 939 aa  656    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45389  predicted protein  39.64 
 
 		 949 aa  652    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000425012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 921 aa  956    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 953 aa  646    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02601  isoleucyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 968 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0485  isoleucyl-tRNA synthetase  58.75 
 
 		 930 aa  1147    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2544  isoleucyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 		 921 aa  951    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 940 aa  650    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0028  isoleucyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 938 aa  676    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00012642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 921 aa  957    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 		 921 aa  959    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl389  isoleucyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 908 aa  694    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0675614  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 921 aa  957    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1121  isoleucyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 940 aa  648    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 931 aa  813    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5054  isoleucyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 960 aa  706    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0698  isoleucyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 938 aa  664    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105082  normal  0.0586161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4313  isoleucyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 924 aa  736    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.375273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0790  isoleucyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 938 aa  647    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102283  normal  0.791214 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 941 aa  654    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 932 aa  671    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1605  isoleucyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 967 aa  669    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0410688  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1059  isoleucyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 940 aa  654    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 939 aa  676    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 929 aa  668    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02591  isoleucyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 968 aa  659    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3774  isoleucyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 978 aa  706    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1892  isoleucyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 946 aa  664    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1277  isoleucyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 917 aa  916    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 940 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 919 aa  708    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02701  isoleucyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 965 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.21788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 927 aa  700    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4230  isoleucyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 940 aa  640    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0354153  hitchhiker  0.0000563381 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2060  isoleucyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 973 aa  680    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 974 aa  671    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 923 aa  699    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 934 aa  673    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 943 aa  653    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 921 aa  957    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0584  isoleucyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 948 aa  650    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0240  isoleucyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 968 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251122  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2437  isoleucyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 954 aa  688    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.202511  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 943 aa  662    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0393  isoleucyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 908 aa  681    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.658478  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1191  isoleucyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 929 aa  712    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.723642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 930 aa  791    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1194  isoleucyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 940 aa  667    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 946 aa  667    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0644  isoleucyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 943 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3629  isoleucyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 938 aa  676    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 		 940 aa  640    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3722  isoleucyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 921 aa  955    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119148  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1252  isoleucyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 917 aa  916    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 932 aa  652    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24331  isoleucyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 1370 aa  656    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1886  isoleucyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 932 aa  803    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0954369  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 931 aa  833    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0598  isoleucyl-tRNA synthetase  58.2 
 
 		 960 aa  1128    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000596981  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0649  isoleucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 943 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159001 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0013  isoleucyl-tRNA synthetase  38.47 
 
 		 947 aa  676    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03171  isoleucyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 967 aa  672    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02611  isoleucyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 969 aa  683    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.771851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 941 aa  661    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 947 aa  660    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3588  isoleucyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 938 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0026  isoleucyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 938 aa  676    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000276203  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1861  isoleucyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 936 aa  696    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 940 aa  657    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1408  isoleucyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 930 aa  770    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0026312  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 908 aa  702    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 942 aa  639    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 940 aa  647    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 937 aa  668    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3586  isoleucyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 1152 aa  730    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 940 aa  645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 940 aa  646    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 941 aa  645    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 943 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 927 aa  833    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1425  isoleucyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 913 aa  706    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1156  isoleucyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 940 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102476  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1626  isoleucyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 919 aa  754    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235357  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2056  isoleucyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 		 932 aa  1044    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1139  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 921 aa  1898    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.357484  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1196  isoleucyl-tRNA synthetase  57.39 
 
 		 944 aa  1089    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1487  isoleucyl-tRNA synthetase  66.77 
 
 		 930 aa  1286    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0783  isoleucyl-tRNA synthetase  59.25 
 
 		 929 aa  1163    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3460  isoleucyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 938 aa  651    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1083  isoleucyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 940 aa  665    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.234482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 928 aa  701    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 954 aa  658    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 940 aa  649    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>