More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_02591 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0026  isoleucyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
938 aa  700    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000276203  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
938 aa  701    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
938 aa  699    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1892  isoleucyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
946 aa  687    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
923 aa  736    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
943 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
916 aa  795    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
939 aa  695    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
940 aa  739    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
921 aa  813    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
953 aa  700    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1425  isoleucyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
913 aa  738    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0485  isoleucyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
930 aa  722    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 
931 aa  831    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
940 aa  711    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0028  isoleucyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
938 aa  700    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00012642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 
921 aa  812    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
921 aa  814    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1059  isoleucyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 
940 aa  710    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
921 aa  814    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5200  isoleucyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
943 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3460  isoleucyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 
938 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011793  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0999  isoleucyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
931 aa  702    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0968  isoleucyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
931 aa  698    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01660  isoleucyl-tRNA synthetase, mitochondrial, putative  36.22 
 
 
1032 aa  636    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1672  isoleucyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
936 aa  722    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.232615  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
941 aa  706    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 
932 aa  651    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1605  isoleucyl-tRNA synthetase  62.86 
 
 
967 aa  1255    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0410688  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0584  isoleucyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
948 aa  689    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128846  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
939 aa  692    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
929 aa  652    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0214  isoleucyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
949 aa  715    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000786038  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3774  isoleucyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 
978 aa  1088    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0644  isoleucyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
943 aa  650    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02601  isoleucyl-tRNA synthetase  94.42 
 
 
968 aa  1876    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
940 aa  705    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
919 aa  741    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4313  isoleucyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
924 aa  734    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.375273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
927 aa  743    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4230  isoleucyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 
940 aa  690    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0354153  hitchhiker  0.0000563381 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2060  isoleucyl-tRNA synthetase  59.79 
 
 
973 aa  1233    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  61.13 
 
 
974 aa  1236    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
923 aa  741    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
934 aa  682    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
943 aa  726    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 
921 aa  812    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0013  isoleucyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
947 aa  702    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0240  isoleucyl-tRNA synthetase  92.05 
 
 
968 aa  1835    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251122  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2437  isoleucyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 
954 aa  1112    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.202511  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
943 aa  682    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2544  isoleucyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
921 aa  825    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2966  isoleucyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
940 aa  653    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.828678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
930 aa  808    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5054  isoleucyl-tRNA synthetase  55.19 
 
 
960 aa  1093    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
946 aa  691    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24331  isoleucyl-tRNA synthetase  60.82 
 
 
1370 aa  1256    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02591  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
968 aa  2000    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
924 aa  742    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02701  isoleucyl-tRNA synthetase  80.37 
 
 
965 aa  1608    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.21788  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0598  isoleucyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
960 aa  719    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000596981  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
932 aa  699    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0953  isoleucyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 
943 aa  642    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.344865 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2208  isoleucyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
934 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1277  isoleucyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
917 aa  808    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0807  isoleucyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
945 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 
943 aa  697    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
940 aa  721    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
941 aa  734    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0481  isoleucyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 
946 aa  650    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
940 aa  709    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
947 aa  710    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45389  predicted protein  48.32 
 
 
949 aa  916    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000425012  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
938 aa  660    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1861  isoleucyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
936 aa  678    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03171  isoleucyl-tRNA synthetase  62.55 
 
 
967 aa  1254    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 
938 aa  693    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
908 aa  734    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
942 aa  699    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
931 aa  801    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
937 aa  713    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3586  isoleucyl-tRNA synthetase  59.56 
 
 
1152 aa  1094    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
940 aa  705    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
940 aa  705    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
941 aa  728    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
943 aa  712    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
927 aa  802    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1252  isoleucyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
917 aa  808    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0287  isoleucyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
965 aa  660    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.547871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 
943 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2056  isoleucyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
932 aa  733    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1139  isoleucyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
921 aa  682    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.357484  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1196  isoleucyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 
944 aa  683    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1487  isoleucyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
930 aa  689    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0783  isoleucyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
929 aa  723    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1121  isoleucyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
940 aa  710    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
944 aa  723    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
928 aa  730    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
954 aa  704    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
940 aa  705    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>