More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0454 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
916 aa  706    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
921 aa  728    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1020  isoleucyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
916 aa  654    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0598  isoleucyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 
960 aa  652    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000596981  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0485  isoleucyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
930 aa  648    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
921 aa  725    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
921 aa  726    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl389  isoleucyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 
908 aa  686    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0675614  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
921 aa  728    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1252  isoleucyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
917 aa  723    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3909  isoleucyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
921 aa  727    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000211806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2544  isoleucyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
921 aa  742    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
931 aa  669    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1468  isoleucyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 
920 aa  656    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1320  Isoleucyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 
926 aa  677    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1245  isoleucyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
921 aa  729    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00257705  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1855  isoleucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
929 aa  666    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.552413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3722  isoleucyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
921 aa  739    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119148  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf589  isoleucyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
889 aa  738    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000236104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
921 aa  725    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1277  isoleucyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
917 aa  723    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1909  isoleucyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
924 aa  746    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0393  isoleucyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
908 aa  712    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.658478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4041  isoleucyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
922 aa  644    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00112426  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
930 aa  677    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1425  isoleucyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
913 aa  638    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3947  isoleucyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
921 aa  729    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000642844  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09270  isoleucyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
929 aa  671    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.157511  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
908 aa  638    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0454  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
900 aa  1858    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.45707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1886  isoleucyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
932 aa  653    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0954369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3996  isoleucyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
921 aa  730    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000796155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
931 aa  666    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1089  isoleucyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
927 aa  657    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000209628  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1349  isoleucyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 
920 aa  663    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
919 aa  654    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
927 aa  681    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2056  isoleucyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
932 aa  681    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1196  isoleucyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
944 aa  681    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0783  isoleucyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
929 aa  637    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1408  isoleucyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
930 aa  645    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0026312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1039  isoleucyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
923 aa  749    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1118  isoleucyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 
938 aa  629  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00413581  normal  0.0891258 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1487  isoleucyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
930 aa  632  1e-179  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
928 aa  630  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1094  isoleucyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
928 aa  630  1e-179  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
927 aa  625  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4313  isoleucyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 
924 aa  627  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.375273  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2437  isoleucyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
954 aa  622  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.202511  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 
924 aa  622  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
939 aa  620  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0999  isoleucyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
931 aa  619  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1626  isoleucyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
919 aa  621  1e-176  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235357  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 
923 aa  618  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
943 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3938  isoleucyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
926 aa  615  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0649  isoleucyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
943 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.159001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0710  isoleucyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
943 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0257753  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 
923 aa  618  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0488  isoleucyl-tRNA synthetase  36.37 
 
 
936 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.502083  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0806  isoleucyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
943 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3269  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0968  isoleucyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 
931 aa  614  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 
946 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1191  isoleucyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
929 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.723642  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
946 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241294  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0644  isoleucyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
943 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0012  isoleucyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 
946 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4559  isoleucyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
943 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.349463  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 
929 aa  609  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4852  isoleucyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
943 aa  611  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
943 aa  612  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1139  isoleucyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
921 aa  609  1e-173  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.357484  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1087  isoleucyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
939 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1194  isoleucyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
940 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000135641  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 
940 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 
941 aa  608  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60370  isoleucyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 
943 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741964  hitchhiker  0.000000957216 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0013  isoleucyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
947 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 
940 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
943 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5200  isoleucyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
943 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1083  isoleucyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
940 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.234482  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
940 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0266  isoleucyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
938 aa  599  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0463751 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
938 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
938 aa  601  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1156  isoleucyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 
940 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102476  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0024  isoleucyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
938 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0199251  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 
940 aa  602  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0698  isoleucyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 
938 aa  599  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105082  normal  0.0586161 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 
934 aa  601  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3757  isoleucyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
925 aa  600  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3235  isoleucyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 
940 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.489815  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3629  isoleucyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
938 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124102  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0030  isoleucyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
938 aa  602  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000755713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0026  isoleucyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
938 aa  601  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000276203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3650  isoleucyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
925 aa  601  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000233753  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0028  isoleucyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 
938 aa  601  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0184357  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00029  hypothetical protein  35.56 
 
 
938 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00165877  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
940 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>