More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_63933 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_10393  hypothetical protein similar to isoleucine/valine tRNA synthetase (Broad)  36.35 
 
 
1000 aa  636    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105138  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63933  isoleucine-tRNA ligase  100 
 
 
983 aa  2041    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.946751  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01660  isoleucyl-tRNA synthetase, mitochondrial, putative  35.78 
 
 
1032 aa  635  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45389  predicted protein  37.76 
 
 
949 aa  611  1e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000425012  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3114  isoleucyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
955 aa  609  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782266  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2437  isoleucyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 
954 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.202511  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02611  isoleucyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
969 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.771851  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0284  isoleucyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
974 aa  598  1e-169  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5054  isoleucyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
960 aa  597  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1909  isoleucyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 
924 aa  592  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5054  isoleucyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
959 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.211178 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1039  isoleucyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 
923 aa  588  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185965  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2060  isoleucyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 
973 aa  588  1e-166  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3996  isoleucyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
921 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000796155  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3586  isoleucyl-tRNA synthetase  37 
 
 
1152 aa  585  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1245  isoleucyl-tRNA synthetase  35.49 
 
 
921 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00257705  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2707  isoleucyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
959 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1605  isoleucyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 
967 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0410688  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17198  predicted protein  35.65 
 
 
1052 aa  579  1e-164  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.847126  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03171  isoleucyl-tRNA synthetase  36.28 
 
 
967 aa  581  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3396  isoleucyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
959 aa  582  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.375781 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
921 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
921 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
921 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3774  isoleucyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 
978 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3909  isoleucyl-tRNA synthetase  35.72 
 
 
921 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000211806 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02701  isoleucyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
965 aa  578  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.21788  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1889  isoleucyl-tRNA synthetase  36 
 
 
923 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3722  isoleucyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 
921 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3947  isoleucyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 
921 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000642844  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1855  isoleucyl-tRNA synthetase  35.66 
 
 
929 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.552413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
921 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1094  isoleucyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 
928 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
921 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09270  isoleucyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 
929 aa  575  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.157511  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24331  isoleucyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
1370 aa  575  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 
908 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1468  isoleucyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 
920 aa  571  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 
919 aa  567  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4041  isoleucyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 
922 aa  567  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00112426  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2232  isoleucyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 
985 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0758  isoleucyl-tRNA synthetase  36.41 
 
 
916 aa  565  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0651932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1349  isoleucyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 
920 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1425  isoleucyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 
913 aa  565  1.0000000000000001e-159  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
941 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
931 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2544  isoleucyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
921 aa  560  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 
941 aa  558  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0962  isoleucyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
927 aa  556  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
953 aa  553  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0718  isoleucyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 
931 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00194665  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 
939 aa  549  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0598  isoleucyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 
960 aa  551  1e-155  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000596981  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1626  isoleucyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
919 aa  551  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235357  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 
943 aa  551  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0483  isoleucyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
918 aa  550  1e-155  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0775  isoleucyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 
937 aa  551  1e-155  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 
954 aa  550  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1087  isoleucyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 
939 aa  547  1e-154  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
930 aa  548  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0580  isoleucyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 
952 aa  547  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0642875  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3938  isoleucyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
926 aa  546  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 
943 aa  548  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0711  isoleucyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
937 aa  546  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.573133  hitchhiker  0.00000334953 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0556  isoleucyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
937 aa  548  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02601  isoleucyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 
968 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 
943 aa  545  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1277  isoleucyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
917 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1252  isoleucyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
917 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0985  isoleucyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 
927 aa  546  1e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1083  isoleucyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 
940 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.234482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0028  isoleucyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 
938 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0184357  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf589  isoleucyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
889 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000236104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
932 aa  540  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 
940 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3216  isoleucyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 
937 aa  542  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3588  isoleucyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 
938 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0790  isoleucyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 
938 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102283  normal  0.791214 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0028  isoleucyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
938 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00012642  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3178  isoleucyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
942 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.69109  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
938 aa  539  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
938 aa  539  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02591  isoleucyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
968 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0051  isoleucyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 
956 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0561272  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0050  isoleucyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 
956 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0223233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0049  isoleucyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 
956 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.479599  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 
940 aa  536  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0780  isoleucyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 
919 aa  538  1e-151  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00333946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00029  hypothetical protein  34.25 
 
 
938 aa  539  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00165877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0050  isoleucyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 
956 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632175  normal  0.280054 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3460  isoleucyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 
938 aa  538  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011793  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0026  isoleucyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
938 aa  538  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000276203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1408  isoleucyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
930 aa  538  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0026312  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0030  isoleucyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
938 aa  538  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000755713  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0050  isoleucyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 
956 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00980  isoleucyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 
942 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0024  isoleucyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
938 aa  538  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0199251  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3629  isoleucyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 
938 aa  538  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124102  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 
924 aa  537  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0906  isoleucyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 
921 aa  535  1e-150  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>