30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF04730 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF04730  nonhistone protein 6, putative  100 
 
 
116 aa  227  3e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0853417  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02885  Non-histone chromosomal protein 6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B995]  52.58 
 
 
106 aa  99  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00549573  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_23779  Nonhistone chromosomal protein 6A  56.58 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.667446  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18991  predicted protein  48.75 
 
 
622 aa  73.9  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0475639  normal  0.137229 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11286  predicted protein  42.67 
 
 
75 aa  69.3  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673219  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24886  predicted protein  47.22 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28032  predicted protein  43.06 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0307251  normal  0.690356 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12674  predicted protein  44.3 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_31946  predicted protein  47.95 
 
 
95 aa  63.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6025  predicted protein  42.47 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04220  nonhistone protein 6, putative  41.07 
 
 
240 aa  54.7  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.219393  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46740  predicted protein  32.26 
 
 
338 aa  51.2  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16581  predicted protein  40.98 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32993  predicted protein  37.5 
 
 
306 aa  50.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161398  normal  0.121587 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45968  predicted protein  38.82 
 
 
304 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04270  HMG1, putative  36.49 
 
 
895 aa  47  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11888  predicted protein  38.81 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43419  predicted protein  30.68 
 
 
343 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.52566  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_12709  non-histone protein 10  33.33 
 
 
218 aa  45.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0597181  normal  0.318516 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49362  predicted protein  32.32 
 
 
363 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25566  predicted protein  34.04 
 
 
338 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_8293  predicted protein  31.25 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261869  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45662  predicted protein  27.87 
 
 
291 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961827  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49506  predicted protein  23.65 
 
 
506 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00216609  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19125  predicted protein  38.78 
 
 
543 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37272  predicted protein  31.03 
 
 
351 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34626  predicted protein  32.93 
 
 
287 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000000196337  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39880  predicted protein  32.93 
 
 
287 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45664  predicted protein  27.55 
 
 
287 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15773  predicted protein  38.89 
 
 
203 aa  40  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0565189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>