17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16581 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_16581  predicted protein  100 
 
 
133 aa  267  4e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6025  predicted protein  47.5 
 
 
147 aa  110  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37272  predicted protein  39.72 
 
 
351 aa  85.5  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24886  predicted protein  29.46 
 
 
200 aa  58.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02885  Non-histone chromosomal protein 6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B995]  29.63 
 
 
106 aa  51.2  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00549573  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04730  nonhistone protein 6, putative  40.98 
 
 
116 aa  51.2  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0853417  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8737  predicted protein  36.76 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12674  predicted protein  42.37 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04220  nonhistone protein 6, putative  31.34 
 
 
240 aa  47  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.219393  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18991  predicted protein  32.47 
 
 
622 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0475639  normal  0.137229 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28032  predicted protein  38.89 
 
 
273 aa  46.2  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0307251  normal  0.690356 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_31946  predicted protein  32.88 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_23779  Nonhistone chromosomal protein 6A  37.5 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.667446  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32993  predicted protein  29.51 
 
 
306 aa  44.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161398  normal  0.121587 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47778  predicted protein  35.9 
 
 
777 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.950731  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11286  predicted protein  28.77 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673219  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_12709  non-histone protein 10  32.95 
 
 
218 aa  41.2  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0597181  normal  0.318516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>