19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_12709 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_12709  non-histone protein 10  100 
 
 		 218 aa  439  9.999999999999999e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0597181  normal  0.318516 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18991  predicted protein  37.66 
 
 		 622 aa  59.7  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0475639  normal  0.137229 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02885  Non-histone chromosomal protein 6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B995]  38.75 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00549573  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_23779  Nonhistone chromosomal protein 6A  37.04 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.667446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12674  predicted protein  34.62 
 
 		 90 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04220  nonhistone protein 6, putative  31.15 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.219393  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28032  predicted protein  32.53 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0307251  normal  0.690356 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04270  HMG1, putative  31.65 
 
 		 895 aa  48.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10785  conserved hypothetical protein  50 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.61156 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45968  predicted protein  32.56 
 
 		 304 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04730  nonhistone protein 6, putative  33.02 
 
 		 116 aa  45.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0853417  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50336  predicted protein  29.75 
 
 		 342 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45662  predicted protein  27.78 
 
 		 291 aa  42.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961827  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10103  HMG box protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04550)  27.37 
 
 		 297 aa  42.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.178896 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33840  predicted protein  31.09 
 
 		 400 aa  42.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11286  predicted protein  28.21 
 
 		 75 aa  42  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673219  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45664  predicted protein  31.82 
 
 		 287 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8737  predicted protein  30.77 
 
 		 89 aa  41.6  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01267  HMG box protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10040)  32.91 
 
 		 326 aa  41.6  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150456 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>