17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE04220 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE04220  nonhistone protein 6, putative  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.219393  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02885  Non-histone chromosomal protein 6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B995]  42.17 
 
 		 106 aa  73.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00549573  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_23779  Nonhistone chromosomal protein 6A  37.8 
 
 		 85 aa  64.7  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.667446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12674  predicted protein  35.37 
 
 		 90 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10103  HMG box protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04550)  36.84 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.178896 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04730  nonhistone protein 6, putative  39.34 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0853417  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66957  high mobility group-like protein  31.25 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18991  predicted protein  39.29 
 
 		 622 aa  54.7  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0475639  normal  0.137229 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_12709  non-histone protein 10  32.94 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0597181  normal  0.318516 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24886  predicted protein  36.11 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32993  predicted protein  38.18 
 
 		 306 aa  52  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161398  normal  0.121587 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04270  HMG1, putative  38.57 
 
 		 895 aa  50.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16581  predicted protein  31.34 
 
 		 133 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_31946  predicted protein  41.18 
 
 		 95 aa  46.2  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28032  predicted protein  25.93 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0307251  normal  0.690356 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8737  predicted protein  30.56 
 
 		 89 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01962  HMG box transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10820)  35.29 
 
 		 675 aa  41.6  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>