13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA04270 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA04270  HMG1, putative  100 
 
 		 895 aa  1820    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02885  Non-histone chromosomal protein 6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B995]  40.26 
 
 		 106 aa  53.9  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00549573  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_23779  Nonhistone chromosomal protein 6A  43.59 
 
 		 85 aa  53.5  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.667446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18991  predicted protein  40.26 
 
 		 622 aa  53.9  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0475639  normal  0.137229 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38097  predicted protein  33.98 
 
 		 429 aa  52  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04900  conserved hypothetical protein  30.05 
 
 		 228 aa  49.3  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01267  HMG box protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10040)  27.31 
 
 		 326 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150456 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_12709  non-histone protein 10  30.95 
 
 		 218 aa  47.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0597181  normal  0.318516 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04220  nonhistone protein 6, putative  31.25 
 
 		 240 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.219393  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04730  nonhistone protein 6, putative  36.49 
 
 		 116 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0853417  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47778  predicted protein  31.91 
 
 		 777 aa  45.8  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.950731  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43419  predicted protein  30.59 
 
 		 343 aa  45.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.52566  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11888  predicted protein  43.28 
 
 		 68 aa  44.3  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>