24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11888 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_11888  predicted protein  100 
 
 		 68 aa  141  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49506  predicted protein  40.2 
 
 		 506 aa  76.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00216609  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45968  predicted protein  50 
 
 		 304 aa  70.5  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43419  predicted protein  40.24 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.52566  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44554  predicted protein  57.89 
 
 		 351 aa  68.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50336  predicted protein  38.46 
 
 		 342 aa  64.3  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45662  predicted protein  39.73 
 
 		 291 aa  60.8  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961827  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38097  predicted protein  35.71 
 
 		 429 aa  60.5  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44432  predicted protein  34.25 
 
 		 659 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.614859  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_23779  Nonhistone chromosomal protein 6A  39.71 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.667446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33840  predicted protein  42.19 
 
 		 400 aa  54.3  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34626  predicted protein  36.99 
 
 		 287 aa  54.3  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000000196337  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39880  predicted protein  36.99 
 
 		 287 aa  54.3  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49938  predicted protein  33.33 
 
 		 326 aa  54.3  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721311  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42576  predicted protein  33.67 
 
 		 461 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.536498  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47350  predicted protein  33.71 
 
 		 415 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02885  Non-histone chromosomal protein 6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B995]  36.76 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00549573  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45664  predicted protein  31.51 
 
 		 287 aa  47.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04730  nonhistone protein 6, putative  38.81 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0853417  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04270  HMG1, putative  43.28 
 
 		 895 aa  44.7  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49937  predicted protein  67.86 
 
 		 428 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01267  HMG box protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10040)  37.7 
 
 		 326 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150456 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48554  DNA-binding transcription factor  29.35 
 
 		 356 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911244  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18991  predicted protein  32.35 
 
 		 622 aa  40.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0475639  normal  0.137229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>