22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_33840 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_33840  predicted protein  100 
 
 
400 aa  830    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50336  predicted protein  52.73 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44554  predicted protein  48.51 
 
 
351 aa  96.7  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49938  predicted protein  33.33 
 
 
326 aa  67  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721311  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50240  predicted protein  39.62 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45968  predicted protein  33.33 
 
 
304 aa  63.5  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43419  predicted protein  35.87 
 
 
343 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.52566  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45662  predicted protein  35.63 
 
 
291 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961827  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49506  predicted protein  30.22 
 
 
506 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00216609  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44432  predicted protein  35.63 
 
 
659 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.614859  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42576  predicted protein  29.73 
 
 
461 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.536498  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38097  predicted protein  35.29 
 
 
429 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11888  predicted protein  42.19 
 
 
68 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39880  predicted protein  33.7 
 
 
287 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34626  predicted protein  33.7 
 
 
287 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000000196337  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49362  predicted protein  33.33 
 
 
363 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48554  DNA-binding transcription factor  27.84 
 
 
356 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911244  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45664  predicted protein  28.81 
 
 
287 aa  49.7  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_23779  Nonhistone chromosomal protein 6A  33.96 
 
 
85 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.667446  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47350  predicted protein  25.69 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12674  predicted protein  29.9 
 
 
90 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39045  predicted protein  32.29 
 
 
368 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>