23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49506 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_49506  predicted protein  100 
 
 
506 aa  1043    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00216609  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43419  predicted protein  39.64 
 
 
343 aa  87.4  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.52566  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42576  predicted protein  39.17 
 
 
461 aa  86.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.536498  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47350  predicted protein  38.66 
 
 
415 aa  86.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38097  predicted protein  38.94 
 
 
429 aa  79.7  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44432  predicted protein  36.43 
 
 
659 aa  77.4  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.614859  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11888  predicted protein  40.2 
 
 
68 aa  76.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50336  predicted protein  37.84 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49938  predicted protein  43.88 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721311  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45662  predicted protein  35.25 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961827  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34626  predicted protein  36.94 
 
 
287 aa  65.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000000196337  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39880  predicted protein  36.04 
 
 
287 aa  63.9  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44554  predicted protein  44.58 
 
 
351 aa  60.1  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33840  predicted protein  30.22 
 
 
400 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39045  predicted protein  33.82 
 
 
368 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48554  DNA-binding transcription factor  32.23 
 
 
356 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911244  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49937  predicted protein  66.67 
 
 
428 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45968  predicted protein  32 
 
 
304 aa  54.3  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49362  predicted protein  28.27 
 
 
363 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50240  predicted protein  31.48 
 
 
295 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45664  predicted protein  27.61 
 
 
287 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02885  Non-histone chromosomal protein 6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B995]  25.38 
 
 
106 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00549573  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_23779  Nonhistone chromosomal protein 6A  29.36 
 
 
85 aa  44.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.667446  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>