14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49362 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_49362  predicted protein  100 
 
 
363 aa  756    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_23779  Nonhistone chromosomal protein 6A  38.54 
 
 
85 aa  54.3  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.667446  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42576  predicted protein  33.33 
 
 
461 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.536498  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49506  predicted protein  28.27 
 
 
506 aa  53.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00216609  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02885  Non-histone chromosomal protein 6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B995]  35.11 
 
 
106 aa  52.8  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00549573  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33840  predicted protein  33.33 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18991  predicted protein  32.58 
 
 
622 aa  50.1  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0475639  normal  0.137229 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44432  predicted protein  27.87 
 
 
659 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.614859  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24886  predicted protein  25.31 
 
 
200 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50336  predicted protein  34.31 
 
 
342 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_31946  predicted protein  36.05 
 
 
95 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43419  predicted protein  27.78 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.52566  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12674  predicted protein  32.22 
 
 
90 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44554  predicted protein  30.34 
 
 
351 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>