20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11286 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_11286  predicted protein  100 
 
 		 75 aa  150  7e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673219  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12674  predicted protein  49.33 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02885  Non-histone chromosomal protein 6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B995]  42.67 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00549573  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_23779  Nonhistone chromosomal protein 6A  42.47 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.667446  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04730  nonhistone protein 6, putative  42.47 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0853417  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24886  predicted protein  41.67 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18991  predicted protein  33.33 
 
 		 622 aa  60.1  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0475639  normal  0.137229 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28032  predicted protein  34.72 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0307251  normal  0.690356 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_31946  predicted protein  34.72 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45968  predicted protein  34.85 
 
 		 304 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15773  predicted protein  41.82 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0565189 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19125  predicted protein  42.86 
 
 		 543 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6025  predicted protein  30.3 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10103  HMG box protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04550)  28 
 
 		 297 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.178896 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04220  nonhistone protein 6, putative  27.4 
 
 		 240 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.219393  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25566  predicted protein  24.62 
 
 		 338 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_12709  non-histone protein 10  28.21 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0597181  normal  0.318516 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16581  predicted protein  28.77 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37272  predicted protein  28.92 
 
 		 351 aa  40.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8737  predicted protein  24.66 
 
 		 89 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>