19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_6025 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_6025  predicted protein  100 
 
 
147 aa  301  1.0000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16581  predicted protein  47.5 
 
 
133 aa  110  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37272  predicted protein  38.85 
 
 
351 aa  97.8  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24886  predicted protein  34.87 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.845597  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02885  Non-histone chromosomal protein 6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B995]  42.03 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00549573  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18991  predicted protein  40.28 
 
 
622 aa  61.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0475639  normal  0.137229 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_23779  Nonhistone chromosomal protein 6A  37.68 
 
 
85 aa  60.5  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.667446  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04730  nonhistone protein 6, putative  42.47 
 
 
116 aa  60.5  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0853417  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47778  predicted protein  39.73 
 
 
777 aa  51.6  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.950731  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_31946  predicted protein  37.25 
 
 
95 aa  50.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12674  predicted protein  38.6 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32993  predicted protein  27.27 
 
 
306 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161398  normal  0.121587 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_8293  predicted protein  31.15 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261869  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11286  predicted protein  30.3 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673219  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04270  HMG1, putative  30 
 
 
895 aa  44.3  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28032  predicted protein  30.77 
 
 
273 aa  43.5  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0307251  normal  0.690356 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38097  predicted protein  31.33 
 
 
429 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15773  predicted protein  39.13 
 
 
203 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0565189 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04220  nonhistone protein 6, putative  27.27 
 
 
240 aa  40  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.219393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>