More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1612 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1612  GDP-L-fucose synthetase  100 
 
 
349 aa  719    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1427  GDP-fucose synthetase  55.23 
 
 
352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.328576  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1764  GDP-fucose synthetase  55.07 
 
 
353 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.50784  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0706  GDP-fucose synthetase  51.14 
 
 
370 aa  368  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02915  GDP-fucose synthetase  50.69 
 
 
362 aa  361  1e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0734964  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1248  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.61 
 
 
362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.86 
 
 
320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1765  GDP-fucose synthetase  48.14 
 
 
353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0212946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1289  GDP-fucose synthetase  46.48 
 
 
357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.86 
 
 
376 aa  334  1e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000078339  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2842  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.12 
 
 
324 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.97 
 
 
311 aa  332  5e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0386838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.13 
 
 
347 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0705  GDP-fucose synthetase  46.18 
 
 
350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0035  GDP-fucose synthetase  45.77 
 
 
312 aa  326  3e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0178713 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.11 
 
 
313 aa  327  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.874346 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46 
 
 
324 aa  326  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0060  GDP-fucose synthetase  47.2 
 
 
308 aa  324  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.396896  normal  0.0281476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1091  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.51 
 
 
309 aa  323  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4219  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.56 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.89 
 
 
324 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.721722  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1282  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.9 
 
 
320 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.25 
 
 
308 aa  312  6.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.93 
 
 
309 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.043091  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.59 
 
 
313 aa  311  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.235303  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0627  GDP-fucose synthetase  45.61 
 
 
314 aa  309  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1775  GDP-L-fucose synthetase  42.45 
 
 
327 aa  309  5e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.35 
 
 
366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2350  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.07 
 
 
312 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.57 
 
 
306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.65 
 
 
321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.757489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0425  GDP-fucose synthetase  41.47 
 
 
346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.8 
 
 
312 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.23 
 
 
323 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429243  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.36 
 
 
313 aa  300  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000746713  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.88 
 
 
316 aa  300  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.38 
 
 
322 aa  297  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1147  GDP-L-fucose synthetase  40.92 
 
 
322 aa  296  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.27 
 
 
310 aa  296  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.35 
 
 
310 aa  294  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.23 
 
 
314 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1700  GDP-fucose synthetase NAD dependent epimerase/dehydratase  42.49 
 
 
314 aa  294  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231068  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.57 
 
 
321 aa  292  7e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2730  GDP-L-fucose synthetase  40.56 
 
 
326 aa  291  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4108  putative nucleotide di-P-sugar epimerase or dehydratase  42.73 
 
 
320 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353388  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.77 
 
 
318 aa  290  2e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1235  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.23 
 
 
320 aa  290  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3862  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  41.95 
 
 
319 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.35 
 
 
325 aa  288  9e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
326 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285763  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2092  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.92 
 
 
322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.7 
 
 
331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.482517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5711  GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase /GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  40.12 
 
 
316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2695  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.48 
 
 
321 aa  281  9e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0303782 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0619  GDP-fucose synthetase  42.32 
 
 
308 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.88 
 
 
317 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5859  bifunctional GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase/GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  40.3 
 
 
333 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.36 
 
 
356 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.435131  normal  0.526104 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.84 
 
 
345 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.141904 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.59 
 
 
332 aa  280  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1864  GDP-L-fucose synthetase  41.79 
 
 
319 aa  279  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1313  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.75 
 
 
320 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.46 
 
 
331 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168438  normal  0.238091 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.61 
 
 
337 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.878977  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.45 
 
 
324 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26933  normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4620  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.3 
 
 
312 aa  276  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.3 
 
 
312 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.144888  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.28 
 
 
321 aa  275  8e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.384606 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2900  GDP-fucose synthetase NAD dependent epimerase/dehydratase  42.25 
 
 
311 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2345  GDP-L-fucose synthetase  40.7 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2987  GDP-L-fucose synthetase  40.7 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201772 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1010  GDP-L-fucose synthetase  40.7 
 
 
321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01958  bifunctional GDP-fucose synthetase: GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase/ GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  40.41 
 
 
321 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.881949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.41 
 
 
321 aa  273  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.171954  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1084  putative GDP-fucose synthetase  39.23 
 
 
316 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01947  hypothetical protein  40.41 
 
 
321 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41 
 
 
312 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195142  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1180  GDP-L-fucose synthetase  40.7 
 
 
321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.7 
 
 
321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.88 
 
 
321 aa  272  7e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.350076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3040  GDP-L-fucose synthetase  39.3 
 
 
321 aa  271  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.3 
 
 
321 aa  271  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092333  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.29 
 
 
335 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0651  GDP-L-fucose synthetase  40.77 
 
 
323 aa  270  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.193687  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1253  GDP-L-fucose synthetase  39 
 
 
321 aa  270  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000974466  hitchhiker  0.000000000000993367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2233  GDP-L-fucose synthetase  39 
 
 
321 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.487603  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.71 
 
 
316 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.1 
 
 
308 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00578096  normal  0.490082 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1315  NAD dependent epimerase/dehydratase  40.58 
 
 
332 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2290  GDP-L-fucose synthetase  39 
 
 
321 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2448  GDP-L-fucose synthetase  38.73 
 
 
321 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0192641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2341  GDP-L-fucose synthetase  38.73 
 
 
321 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2334  GDP-L-fucose synthetase  38.73 
 
 
321 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.371509 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0450  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.48 
 
 
333 aa  265  8e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0947626  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.17 
 
 
305 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.89 
 
 
314 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.660712  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0771  bifunctional GDP-fucose synthetase: GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase and GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  38.9 
 
 
322 aa  265  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0933619 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0418  fucose synthetase family protein  39.31 
 
 
326 aa  264  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0709177  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.95 
 
 
326 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>