More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1248 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1248  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
362 aa  755    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1289  GDP-fucose synthetase  69.77 
 
 
357 aa  530  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02915  GDP-fucose synthetase  60.34 
 
 
362 aa  460  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0734964  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1764  GDP-fucose synthetase  59.15 
 
 
353 aa  437  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.50784  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1427  GDP-fucose synthetase  52.26 
 
 
352 aa  404  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.328576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.54 
 
 
321 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.757489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0035  GDP-fucose synthetase  51.4 
 
 
312 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0178713 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0706  GDP-fucose synthetase  51.26 
 
 
370 aa  373  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.14 
 
 
376 aa  372  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000078339  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.22 
 
 
347 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4219  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.4 
 
 
309 aa  363  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.41 
 
 
320 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.98 
 
 
324 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0425  GDP-fucose synthetase  50.14 
 
 
346 aa  362  8e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
324 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.721722  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1612  GDP-L-fucose synthetase  47.61 
 
 
349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.86 
 
 
313 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.235303  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0060  GDP-fucose synthetase  51 
 
 
308 aa  355  6.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.396896  normal  0.0281476 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.28 
 
 
321 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.73 
 
 
313 aa  353  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.874346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1091  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.57 
 
 
309 aa  352  7e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2842  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.28 
 
 
324 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2730  GDP-L-fucose synthetase  51.11 
 
 
326 aa  349  5e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
366 aa  348  7e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.16 
 
 
313 aa  348  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000746713  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0627  GDP-fucose synthetase  52.53 
 
 
314 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.72 
 
 
322 aa  346  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.8 
 
 
310 aa  345  8.999999999999999e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1775  GDP-L-fucose synthetase  50.42 
 
 
327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1282  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.44 
 
 
320 aa  342  5e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.86 
 
 
309 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.043091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1147  GDP-L-fucose synthetase  49.15 
 
 
322 aa  339  4e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.42 
 
 
326 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.15 
 
 
311 aa  335  5e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0386838  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.86 
 
 
316 aa  336  5e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.04 
 
 
306 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1313  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.01 
 
 
320 aa  335  5.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.74 
 
 
310 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1864  GDP-L-fucose synthetase  49 
 
 
319 aa  333  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1235  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.93 
 
 
320 aa  334  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.74 
 
 
323 aa  333  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429243  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
337 aa  332  4e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.878977  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2350  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.86 
 
 
312 aa  332  5e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.46 
 
 
325 aa  332  5e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.57 
 
 
321 aa  331  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.350076 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0651  GDP-L-fucose synthetase  49.3 
 
 
323 aa  330  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.193687  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1765  GDP-fucose synthetase  46.46 
 
 
353 aa  330  2e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0212946  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.57 
 
 
308 aa  331  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.78 
 
 
324 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26933  normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4108  putative nucleotide di-P-sugar epimerase or dehydratase  49.14 
 
 
320 aa  329  4e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353388  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3040  GDP-L-fucose synthetase  49.43 
 
 
321 aa  329  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.43 
 
 
321 aa  329  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092333  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2345  GDP-L-fucose synthetase  47.59 
 
 
321 aa  328  7e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1253  GDP-L-fucose synthetase  49.14 
 
 
321 aa  328  8e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000974466  hitchhiker  0.000000000000993367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1010  GDP-L-fucose synthetase  47.59 
 
 
321 aa  328  9e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.02 
 
 
312 aa  328  9e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01958  bifunctional GDP-fucose synthetase: GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase/ GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  47.31 
 
 
321 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.881949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.31 
 
 
321 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.171954  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2987  GDP-L-fucose synthetase  47.59 
 
 
321 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.14 
 
 
331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168438  normal  0.238091 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01947  hypothetical protein  47.31 
 
 
321 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.59 
 
 
321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1180  GDP-L-fucose synthetase  47.59 
 
 
321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.31 
 
 
314 aa  326  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1700  GDP-fucose synthetase NAD dependent epimerase/dehydratase  47.89 
 
 
314 aa  325  8.000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231068  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
318 aa  325  1e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.09 
 
 
335 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0771  bifunctional GDP-fucose synthetase: GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase and GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  46.93 
 
 
322 aa  322  5e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0933619 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2092  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.21 
 
 
322 aa  322  6e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2334  GDP-L-fucose synthetase  47.88 
 
 
321 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.371509 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2233  GDP-L-fucose synthetase  47.74 
 
 
321 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.487603  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1084  putative GDP-fucose synthetase  46.65 
 
 
316 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2341  GDP-L-fucose synthetase  47.74 
 
 
321 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5711  GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase /GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  47.56 
 
 
316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0705  GDP-fucose synthetase  43.82 
 
 
350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2967  GDP-L-fucose synthetase  47.85 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296227 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2448  GDP-L-fucose synthetase  48.29 
 
 
321 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0192641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2290  GDP-L-fucose synthetase  47.74 
 
 
321 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5859  bifunctional GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase/GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  47.71 
 
 
333 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.25 
 
 
331 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.482517 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0619  GDP-fucose synthetase  46.22 
 
 
308 aa  317  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.05 
 
 
319 aa  316  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2900  GDP-fucose synthetase NAD dependent epimerase/dehydratase  47.58 
 
 
311 aa  315  5e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2695  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.47 
 
 
321 aa  315  6e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0303782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3862  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  45.76 
 
 
319 aa  315  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.59 
 
 
332 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.85 
 
 
314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.660712  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.71 
 
 
308 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00578096  normal  0.490082 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.88 
 
 
321 aa  311  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.384606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2116  putative nucleotide di-P-sugar epimerase or dehydratase  46.42 
 
 
319 aa  310  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.35 
 
 
317 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2384  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.69 
 
 
316 aa  301  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.73165  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0450  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.54 
 
 
333 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0947626  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.15 
 
 
326 aa  295  8e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4142  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.5 
 
 
313 aa  295  9e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0702  GDP-L-fucose synthase  45.35 
 
 
332 aa  294  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0806  GDP-L-fucose synthase  45.35 
 
 
332 aa  294  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.76 
 
 
305 aa  292  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4242  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.94 
 
 
311 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0896711  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0254  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.79 
 
 
329 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>