127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1980 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1980  siderophore-interacting protein  100 
 
 		 225 aa  466  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.654541  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6633  siderophore-interacting protein  28.85 
 
 		 281 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5556  Siderophore-interacting protein-like protein  30.43 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  24.02 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0911  siderophore-interacting protein  26.06 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0168967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4029  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.37 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03709  hypothetical protein  26.09 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  24.84 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4066  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  25.69 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515055 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  29.21 
 
 		 284 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3953  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  25.69 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.568339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  24.37 
 
 		 383 aa  52  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2259  FAD-binding 9, siderophore-interacting  22.03 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  28.75 
 
 		 311 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  24.14 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  25.61 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  27.08 
 
 		 290 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.92 
 
 		 375 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2220  Siderophore-interacting protein  24.18 
 
 		 298 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683509  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0997  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  27.46 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000118529 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  27.93 
 
 		 279 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  21.84 
 
 		 271 aa  48.9  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  21.31 
 
 		 281 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  23.61 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06920  hypothetical protein  22.98 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  24.81 
 
 		 375 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  24.53 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  27.16 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  25.93 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  28.42 
 
 		 270 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1452  Siderophore-interacting protein  23.16 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.100932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3532  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  19.26 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2919  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  22.22 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000911  utilization protein for catechol-siderophore  23.72 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  21.19 
 
 		 281 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  23.28 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2780  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  28.81 
 
 		 336 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.43 
 
 		 406 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3687  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  25.95 
 
 		 289 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443256  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.87 
 
 		 340 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.43 
 
 		 387 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  24.81 
 
 		 375 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  26.12 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  27.36 
 
 		 362 aa  45.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  24.82 
 
 		 248 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  24.82 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  25.78 
 
 		 356 aa  45.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  22.84 
 
 		 252 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  26.21 
 
 		 281 aa  45.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  20.45 
 
 		 275 aa  45.4  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  31.25 
 
 		 304 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0589  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.74 
 
 		 300 aa  45.1  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  25 
 
 		 278 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0091  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  24.82 
 
 		 250 aa  45.1  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  28.97 
 
 		 325 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  24.07 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  24.07 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2825  ferredoxin  24.52 
 
 		 336 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0703333  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  24.07 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  24.07 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  24.07 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  24.07 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  24.07 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2876  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.1 
 
 		 415 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.55 
 
 		 388 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  22.22 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  23.26 
 
 		 379 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  27.85 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0987  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.1 
 
 		 408 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00101326  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  24.78 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2227  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  31 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  24.03 
 
 		 381 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  27.62 
 
 		 372 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1108  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.1 
 
 		 418 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  25 
 
 		 319 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  19.86 
 
 		 348 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0941  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.1 
 
 		 418 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.108525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0979  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.1 
 
 		 418 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25350  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.21 
 
 		 407 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0943  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.1 
 
 		 418 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1496  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  21.33 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.615872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0929  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.48 
 
 		 418 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.340506  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0410  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.51 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0945  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.48 
 
 		 418 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0537088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2165  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.35 
 
 		 407 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3433  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.48 
 
 		 418 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3558  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.48 
 
 		 418 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00671502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  23.02 
 
 		 365 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2173  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  22.73 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0791652  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3361  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.48 
 
 		 418 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00861649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2591  Siderophore-interacting protein  22.46 
 
 		 304 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000968447  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0536  hypothetical protein  24.48 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3395  vibriobactin utilization protein ViuB  24.74 
 
 		 295 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.472238 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6582  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.69 
 
 		 341 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10458  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32140  anthranilate dioxygenase reductase  25.78 
 
 		 340 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  24.78 
 
 		 361 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  24.51 
 
 		 267 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3612  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  27.5 
 
 		 415 aa  42.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.538206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  21.98 
 
 		 250 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  23.74 
 
 		 605 aa  42.4  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>