207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06780 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  100 
 
 
284 aa  566  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  51.36 
 
 
247 aa  242  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2762  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  40.14 
 
 
299 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2566  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  40.48 
 
 
312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2401  Siderophore-interacting protein  42.28 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000149826  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2998  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  38.41 
 
 
298 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0124793  normal  0.0292007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  41.82 
 
 
280 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  41.67 
 
 
281 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  38.85 
 
 
340 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5549  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  39.94 
 
 
308 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438451  normal  0.147517 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  40.82 
 
 
270 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3213  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  39.61 
 
 
325 aa  186  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000110595 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1437  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  38.41 
 
 
315 aa  186  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3532  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  40.8 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3473  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  38.28 
 
 
305 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100108  hitchhiker  0.00465132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  43.19 
 
 
267 aa  181  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  41.8 
 
 
289 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  42.05 
 
 
277 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  40.98 
 
 
275 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  41.18 
 
 
259 aa  178  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  40.98 
 
 
283 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  39.25 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  42.21 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  40.3 
 
 
270 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2292  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.66 
 
 
310 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636042  normal  0.986884 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  40.15 
 
 
275 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  40.15 
 
 
275 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  40.15 
 
 
275 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  40.15 
 
 
275 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  40.15 
 
 
275 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  40.15 
 
 
275 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  40.15 
 
 
275 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  39.77 
 
 
273 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  40.15 
 
 
273 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3252  hypothetical protein  34.43 
 
 
302 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1601  Siderophore-interacting protein  41.54 
 
 
265 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38220  hypothetical protein  34.1 
 
 
302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  40.47 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0424  Siderophore-interacting protein  35.08 
 
 
321 aa  166  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.625757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3865  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  35.99 
 
 
311 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2101  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  40.86 
 
 
296 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  39.64 
 
 
277 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  39.18 
 
 
273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  39.18 
 
 
273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  39.39 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  38.91 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  38.26 
 
 
275 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0237  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  39.34 
 
 
266 aa  162  8.000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  38.58 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4137  siderophore-interacting protein  38.79 
 
 
281 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4106  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  43.14 
 
 
280 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35080  siderophore-interacting protein  33.13 
 
 
345 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  39.03 
 
 
273 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  38.06 
 
 
285 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  38.06 
 
 
285 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  40.07 
 
 
274 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  35.77 
 
 
277 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  38.06 
 
 
285 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2919  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.7 
 
 
272 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  38.43 
 
 
281 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3789  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.15 
 
 
322 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0118  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  38.15 
 
 
370 aa  155  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  37.4 
 
 
255 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  37.3 
 
 
274 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1914  siderophore-interacting protein  32.42 
 
 
300 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2932  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  37.5 
 
 
275 aa  152  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453632  hitchhiker  0.000505579 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  39.15 
 
 
273 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12909  mycobactin utilization protein viuB  39.64 
 
 
283 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000043443  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1159  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  38.1 
 
 
281 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139634  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3016  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  39.38 
 
 
275 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  39.22 
 
 
288 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3931  siderophore-interacting protein  32.65 
 
 
346 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  39.41 
 
 
267 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21440  siderophore-interacting protein  39.06 
 
 
277 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal  0.530536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.69 
 
 
279 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  37.65 
 
 
623 aa  148  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1787  Siderophore-interacting protein  33.86 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00316265  normal  0.123717 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3731  Siderophore-interacting protein  30.97 
 
 
356 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  36.22 
 
 
255 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  36.76 
 
 
261 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.5 
 
 
274 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  42.56 
 
 
311 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0112  Siderophore-interacting protein  40.16 
 
 
277 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.5 
 
 
271 aa  141  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0628  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.28 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4467  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.85 
 
 
301 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251848  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  32.82 
 
 
625 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4066  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.45 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515055 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3953  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.45 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.568339  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  39.08 
 
 
617 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  37.07 
 
 
272 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4183  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.85 
 
 
301 aa  135  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  36.33 
 
 
273 aa  135  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03709  hypothetical protein  33.7 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0924  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.8 
 
 
294 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1802  vibriobactin utilization protein ViuB  33.98 
 
 
271 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  37.99 
 
 
304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.41 
 
 
281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  34.48 
 
 
253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  38.67 
 
 
290 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>