197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3789 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3789  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  100 
 
 		 322 aa  658    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3252  hypothetical protein  58.53 
 
 		 302 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38220  hypothetical protein  58.19 
 
 		 302 aa  342  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0924  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  50 
 
 		 294 aa  285  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2998  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  49.17 
 
 		 298 aa  271  8.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0124793  normal  0.0292007 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0628  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  47.95 
 
 		 299 aa  265  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4183  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  46.39 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0589  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  48.46 
 
 		 300 aa  258  9e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4467  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  45.7 
 
 		 301 aa  255  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251848  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1914  siderophore-interacting protein  48.32 
 
 		 300 aa  255  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5549  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  42.66 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438451  normal  0.147517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35080  siderophore-interacting protein  40.36 
 
 		 345 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2762  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  41.78 
 
 		 299 aa  208  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1437  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  40.06 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3213  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  39.02 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000110595 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2292  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  38.67 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636042  normal  0.986884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3865  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  38.82 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2566  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  40.41 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108893 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0424  Siderophore-interacting protein  39.8 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.625757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3473  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  38.96 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100108  hitchhiker  0.00465132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3931  siderophore-interacting protein  37.54 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  37.73 
 
 		 625 aa  176  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1787  Siderophore-interacting protein  36.42 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00316265  normal  0.123717 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3731  Siderophore-interacting protein  35.24 
 
 		 356 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4105  Siderophore-interacting protein  38.24 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779952  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  34.15 
 
 		 284 aa  155  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2401  Siderophore-interacting protein  34.11 
 
 		 276 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000149826  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04680  siderophore-interacting protein  31.9 
 
 		 331 aa  143  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  36.52 
 
 		 247 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3016  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.99 
 
 		 275 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  33.88 
 
 		 340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3532  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.22 
 
 		 257 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0112  Siderophore-interacting protein  31.44 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2932  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  30.64 
 
 		 275 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453632  hitchhiker  0.000505579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  31.49 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21440  siderophore-interacting protein  30.43 
 
 		 277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal  0.530536 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08230  siderophore-interacting protein  32.62 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.227116  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  31.45 
 
 		 281 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.75 
 
 		 283 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  33.79 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0833  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.64 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.78 
 
 		 271 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  31.47 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  31.21 
 
 		 289 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.76 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.49 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  31.99 
 
 		 261 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  33.21 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  33.68 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12909  mycobactin utilization protein viuB  34.58 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000043443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  35.42 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.69 
 
 		 281 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1601  Siderophore-interacting protein  30.77 
 
 		 265 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  32.77 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  32.77 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  33.79 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  31.85 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.77 
 
 		 247 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0237  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.47 
 
 		 266 aa  106  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  30.77 
 
 		 277 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3561  Siderophore-interacting protein  32.54 
 
 		 283 aa  106  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  33.21 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0773  siderophore-interacting protein  32.65 
 
 		 279 aa  105  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.71701  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  29.06 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  30.77 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  32.43 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2919  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.18 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  30.77 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  31.83 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  33.45 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4137  siderophore-interacting protein  31.86 
 
 		 281 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3395  vibriobactin utilization protein ViuB  30.64 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.472238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  33.22 
 
 		 267 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  30.42 
 
 		 250 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  31.06 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  29.76 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  31.49 
 
 		 617 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  30.74 
 
 		 623 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2101  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.13 
 
 		 296 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  30.07 
 
 		 251 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  30.58 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  29.72 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0091  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  29.37 
 
 		 250 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  29.37 
 
 		 248 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.76 
 
 		 283 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4106  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.33 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  28.67 
 
 		 265 aa  97.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  29.76 
 
 		 253 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  27.84 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  27.4 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  28.37 
 
 		 277 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  30.61 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  27.15 
 
 		 273 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  27.15 
 
 		 273 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1802  vibriobactin utilization protein ViuB  26.28 
 
 		 271 aa  94  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  29.45 
 
 		 279 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  33.1 
 
 		 348 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03709  hypothetical protein  30.56 
 
 		 277 aa  93.2  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  29.76 
 
 		 253 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  27.8 
 
 		 247 aa  93.2  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>