205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1860 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  100 
 
 
273 aa  548  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  46.59 
 
 
617 aa  202  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  43.36 
 
 
288 aa  198  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  43.35 
 
 
311 aa  195  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  41.26 
 
 
279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  43.13 
 
 
270 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  44.09 
 
 
290 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  44.84 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  41.76 
 
 
281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1452  Siderophore-interacting protein  44.32 
 
 
275 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.100932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  43.03 
 
 
278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  41.09 
 
 
270 aa  178  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3687  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  45.31 
 
 
289 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443256  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  39.47 
 
 
273 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  40.07 
 
 
275 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  38.93 
 
 
283 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  39.34 
 
 
275 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  39.34 
 
 
275 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  39.34 
 
 
275 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  39.34 
 
 
275 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  39.34 
 
 
275 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  39.34 
 
 
275 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  39.34 
 
 
275 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  41.35 
 
 
623 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  41.63 
 
 
265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  42.11 
 
 
247 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  38.4 
 
 
275 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  39.33 
 
 
273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  39.33 
 
 
273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  39.33 
 
 
273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  38.72 
 
 
273 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  40.39 
 
 
281 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  37.63 
 
 
273 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  42.4 
 
 
348 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  44.35 
 
 
289 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  36.44 
 
 
255 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  38.31 
 
 
261 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  39.31 
 
 
278 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  40.75 
 
 
277 aa  155  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  37.35 
 
 
255 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  41.73 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  39.15 
 
 
284 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  38.95 
 
 
304 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0118  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  39.41 
 
 
370 aa  148  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  40.62 
 
 
277 aa  148  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3539  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  37.6 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  35.2 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  41.76 
 
 
273 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  36.14 
 
 
253 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  35.2 
 
 
253 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0336  siderophore-interacting protein  42.63 
 
 
361 aa  142  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  41.8 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  39.53 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  42.39 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1901  siderophore-interacting protein  36.94 
 
 
366 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  35.48 
 
 
252 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3330  Siderophore-interacting protein  39.79 
 
 
287 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.796651  normal  0.319415 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0773  siderophore-interacting protein  41.18 
 
 
279 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.71701  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  41.04 
 
 
274 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1802  vibriobactin utilization protein ViuB  34.35 
 
 
271 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  40.89 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2448  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.29 
 
 
256 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  37.65 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.55 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  38.49 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  38.37 
 
 
281 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  37.3 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  38.11 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  35.11 
 
 
277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  37.31 
 
 
285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  37.31 
 
 
285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  38.02 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4137  siderophore-interacting protein  37.25 
 
 
281 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0313  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.08 
 
 
270 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0911  siderophore-interacting protein  35.27 
 
 
234 aa  125  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0168967  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6722  Siderophore-interacting protein  36.4 
 
 
349 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550685  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2101  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  38.2 
 
 
296 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2366  Siderophore-interacting protein  38.02 
 
 
258 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.277442  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  35.6 
 
 
266 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000911  utilization protein for catechol-siderophore  30.53 
 
 
257 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  32.43 
 
 
250 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  32.43 
 
 
250 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1159  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  38.27 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139634  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06920  hypothetical protein  30.19 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  30.35 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2173  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.08 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0791652  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.05 
 
 
247 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  32.05 
 
 
251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02939  predicted siderophore interacting protein  36.56 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0631  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.56 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.231291  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02889  hypothetical protein  36.56 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3506  siderophore-interacting protein  36.56 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.960559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3561  Siderophore-interacting protein  37.69 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4383  siderophore-interacting protein  36.56 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347587  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3535  siderophore-interacting protein  36.56 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0880891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  36.56 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  32.43 
 
 
252 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3364  siderophore-interacting protein  36.12 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0792017  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  32.54 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3251  siderophore-interacting protein  35.68 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>